老規矩，先奉上學習資料鏈接： https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/...
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2023-MutationalPatterns包學習筆記（一） -
跟著NC做基因組數據分析本期內容為[跟著NC做基因組數據分析]，這是你需要的教程，對你一定有幫助。 前言今天花費找文章，看到一篇關于基因組，組裝的文章，主要是里面的圖吸...
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外顯子WES數據檢測CNV方法梳理與軟件匯總總結（看的有限）： 1. 大部分方法為基于深度（劃分區間檢測）的方法（FPKM、區域堿基數的類似FPKM算法）。 2.大部分軟件會使用對照樣本作...
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用R語言對vcf文件進行數據挖掘.5 vcf可視化1目錄 前言[http://www.lxweimin.com/p/729673778e43] 方法簡介[https://www.jianshu.c...
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取兩個VCF的差集
參考：https://www.biostars.org/p/113509/#113509[https://www.biostars.org/p/...
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家系分析軟件匯總
作者：charon審稿：童蒙編輯：amethyst 二代測序技術蓬勃發展，已經用于臨床上輔助疾病診斷，利用二代測序數據挖掘孟德爾遺傳病相關的基因...
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單個vcf文件轉maf文件，單樣本maf合并成多樣本maf文件在網上偶然看見了maftools，想用自己的vcf文件嘗試，因此在網上找了教程來進行這一轉換。 本文章旨在解決兩個問題，一，vcf 轉maf過程...
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如何用Conda安裝GATK？劉小澤寫于2020.9.2現在conda的使用越來越方便，用的人也越來越多，就是因為學習成本簡單，比較容易上手，并且不需要root權限以及修改b...
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neoantigen計算機預測的一般流程簡介
首先,簡單介紹一下新抗原(neoantigen)的含義,它是腫瘤細胞特異性表達而正常細胞(除了睪丸之外)的一種抗原性多肽, 它能被免疫系統的T細...
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腫瘤新生抗原預測軟件和參數選擇癌癥疫苗靶向腫瘤細胞的抗原可以大致分為兩類：腫瘤相關性抗原（tumor-associatied self-antigen）以及腫瘤特異性抗原（t...
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