Paper 2：轉錄組+miRNA+降解組相關文章 標題：Integrated transcriptome, small RNA and deg...
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Paper 2：轉錄組+miRNA+降解組相關文章
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方便快捷的smallRNA數據分析流程前言 ??今天來跟大家分享一個smallRNA的分析流程——sRNAnalyzer[http://srnanalyzer.systemsbiol...
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Ribo-seq分析必看文獻 | 知識（一）：15年玉米Ribosome profiling reveals dynamic translational landscape in maize seed...
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【ChIP-seq 實戰】五、合并bam和去除PCR重復
這里是佳奧！ 獲得了比對的bam文件，生成了index的bai文件，生成了比對結果stat文件。 合并bam文件和去除PCR重復沒有嚴格先后順序...
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RNA seq 標準化 不同方式
Normalization 差異基因分析工作流程的第一步是計數歸一化，這對于準確比較樣品之間的基因表達是必需的。 RNA-Seq（RNA測序的縮...
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轉錄組學習六（reads計數與標準化）
轉錄組學習一（軟件安裝） 轉錄組學習二（數據下載） 轉錄組學習三（數據質控） 轉錄組學習四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉錄組學習五（...
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DESeq2的多組比較
DESeq2 multiple group comparison (biostars.org)[https://www.biostars.org...
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bamtofastq 將bam文件轉成fastq文件目標 通常比對好的bam，如果需要重新比對，需要將文件轉成原始的測序文件的格式fastq。通過bedtools中的bamtofastq 能夠將文...
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GSEA結果解讀
上一篇GSEA可以做什么[http://www.lxweimin.com/p/1cc9f6c20ef6]之后，繼續進行結果解讀 1 Enrich...
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【ChIP-seq 實戰】七、可視化（IGV部分）這里是佳奧！ 獲得了peaks之后我們導入IGV檢查。 1 deeptools初探 bamCoverage的基本用法 得到的bw文件就可以送去I...
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