本次推送是文獻分享22的對應內容。我與生信，公眾號：我與生信文獻分享22：泛基因組解析柑橘亞科進化以及柑橘果實中檸檬酸積累的關鍵基因[http:...
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生信分析22：完整的轉座子注釋流程 -
小鬼的sRNA分析筆記（一）|| tsRNA分類分析：seqac包標題：tsRNA分類分析：seqac包 tRNA的二級結構如下： 根據其二級結構，tsRNA分類如下： 早期研究報道，tiRNAs通過血管生成素...
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跟著NC做基因組數據分析本期內容為[跟著NC做基因組數據分析]，這是你需要的教程，對你一定有幫助。 前言今天花費找文章，看到一篇關于基因組，組裝的文章，主要是里面的圖吸...
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【基因組學】使用StringTie+gffread鑒定基因的新轉錄本寫在前面 ????轉錄組通常被用來尋找差異基因，但是有的時候我們想看一下已報道的基因是否存在可變剪切現象，即新轉錄本的挖掘，這個時候就需要利用S...
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RNAseq比對流程pipeline腳本自己在參考大牛的基礎上，總結了RNAseq比對流程pipeline腳本。在做好前期準備工作后，可以一步完成從fastq到表達矩陣的所有步驟，目前...
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轉錄組數據分析之時序分析（maSigPro包）在轉錄組數據分析過程中，我們最常做的是不同處理方式的樣本之間的比較（Treated vs Control），這時候我們采用“DEG分析+path...
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tximport 將 Salmon 定量結果導入 DESeq2
在《Salmon 進行轉錄本定量》[http://www.lxweimin.com/p/f62fd85113d3]文章介紹了 Salmon 定量...
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使用edgeR進行無重復差異表達分析寫這篇文章一部分原因是填2年前的一個坑 轉錄組入門（7）：差異表達分析. 另一部分原因是GQ最近又在搞一波無重復的差異表達分析, 所以專門去學...
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Gfold說明書（備份）
本文資料來源 https://web.archive.org/web/20161125133249/http://compbio.tongji....
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RNA-seq完整分析過程linux基本命令 第六章 Linux文件與目錄管理 極客學院服務器 高通量相關基礎知識 生信一百講 1、 Anaconda Anaconda是...
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