前言 DNA 甲基化在許多細胞進程中扮演重要的角色，例如胚胎發育、基因印跡、X 染色體失活和維持染色體穩定性。 在哺乳動物中，DNA 甲基化很少...
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TCGA 數據分析實戰 —— 差異甲基化區域模體分析 -
腫瘤甲基化Tumors are often characterized by an imbalance in cytosine methylation a...
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計算不同組別間差異甲基化位點和區域的R包—DSSDSS (Dispersion Shrinkage for Sequencing data)，為基于高通量測序數據的差異分析而設計的Biocon...
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FEM：整合RANSEQ和DNA甲基化數據分析的R包FEM是一個整合RANSEQ和DNA甲基化數據的R包，由Andrew E. Teschendorff 和 Zhen Yang 開發、維護。 不多...
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TCGA甲基化數據質量控制和差異分析（使用ChAMP包）參考文章：1.甲基化芯片入門學習-ChAMP包（二）2.TCGA數據庫的癌癥甲基化芯片數據重分析3.TCGA甲基化芯片數據質控和過濾4.甲基化芯...
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???[R]甲基化②ChAMP幫助文檔譯[下]-甲基化分析流程(The Chip Analysis Methylation Pipeline)1.甲基化①ChAMP幫助文檔譯[上]-甲基化分析流程(The Chip Analysis Methylation Pipeline) 6.Ch...
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甲基化芯片數據的差異分析火山圖有誤，已更新 前情提要 前面兩個步驟已經完成了數據下載、探針過濾、數據質控、樣本過濾。 此處需要補充兩個知識點： beta值的生物學意義 ...
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TCGA甲基化芯片數據質控和過濾在step1中，我們獲得了TCGA中OSCC 的32個病人的T-N配對樣本和對應的臨床信息,并將其組成了一個名為my_Load的ChAMP對象。...
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TCGA甲基化芯片數據的差異基因的生存分析與富集分析4.將差異甲基化位點拿來做批量生存分析 logrank test批量生存分析 這里和TCGA系列里的內容是一樣的，詳見：兩種方法批量做生存分析 ...
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RRBS甲基化分析流程【基本流程】Bismark—Methylkit—Genomation—GO/KEGG 只求自己記得 如果有人搜到了這個 請你只看上面的四個基本流...
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