文獻(xiàn)代表 標(biāo)題：Elevated rates of horizontal gene transfer in the industrialized...
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水平基因轉(zhuǎn)移HGT
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單細(xì)胞研究 | Cell BLAST：一個(gè)自帶高質(zhì)量參考數(shù)據(jù)庫(kù)的scRNA-seq數(shù)據(jù)檢索/注釋工具
遇到批次效應(yīng) 做單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析時(shí)，我們常常用到不同時(shí)期或不同測(cè)序平臺(tái)的數(shù)據(jù)，即使是同樣的細(xì)胞類型也可能不能聚類到一個(gè)細(xì)胞群中。 精確的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄...
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seqtk的使用說明
本文完全參考自簡(jiǎn)書文章：http://www.lxweimin.com/p/2671198ae625，本文僅供個(gè)人參考學(xué)習(xí)，如有需要請(qǐng)?jiān)L問原作者...
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seqkit的安裝與使用安裝： conda install seqkit ref:seqkit一個(gè)FASTA/Q序列處理神器 - 遺世獨(dú)立的愚公 - 博客園 一、序列操...
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都8102年了，還用fastq-dump，快換fasterq-dump吧之前寫過一篇文章Fastq-dump: 一個(gè)神奇的軟件[http://www.lxweimin.com/p/a8d70b66794c]， 詳細(xì)介...
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如何從vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位點(diǎn)？
需求 客戶的一個(gè)簡(jiǎn)單需求： 我有一批功能基因位點(diǎn)，想從重測(cè)序的群體材料中找到這些位點(diǎn)，如何批量快速獲得？ 示例文件 gene.txt test....
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生物信息學(xué)分析工具
為了使NCBI的資料庫(kù)發(fā)揮更大的進(jìn)階應(yīng)用價(jià)值，NCBI研究團(tuán)隊(duì)發(fā)展許多可以做生物醫(yī)學(xué)資料採(cǎi)礦與資料分析的檢索與分析工具。在此依工具的使用目的將其...
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如何處理NGS數(shù)據(jù)中的污染？
本次文章和大家討論一個(gè)大家可能胡遇到很常見的一個(gè)問題，在測(cè)序中我們很難避免引入一些微生物污染或者人類的污染，例如，我想測(cè)序擬南芥，其中由于實(shí)驗(yàn)員...
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Sam/Bam文件格式詳解
作者：麥茬道審稿：童蒙編輯：amethyst 隨著生物信息數(shù)據(jù)的爆發(fā)式增長(zhǎng)，存儲(chǔ)生物信息的文件格式也多樣化起來，不同的文件格式往往有不同的目的：...
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minimap2 簡(jiǎn)單筆記
官網(wǎng)：https://github.com/lh3/minimap2[https://github.com/lh3/minimap2] 幫助：h...
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