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STOmics-seq：Stereopy教程（二）本期內容展示Stereopy的Cell Bin的處理，即bin1的時候的教程 一、代碼教程 1、讀取數據生成 StereoExpData 對象 ...
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STOmics-seq：Stereopy教程（一）一、背景介紹 大家其實對華大測序的原理什么的都知道，但是以下概念是比較重要的，什么是DNB，bin，我們怎么選擇binsize的大小等問題就至關...
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R包安裝時報錯 package xxx is not available (for R versionXXX)
Warning in install.packages :package ‘STRINGdb’ is not available (for R ...
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單細胞量化代謝活性-scMetabolism一、scMetabolism的安裝 scMetabolism是一個R包，用于在單細胞分辨率下量化代謝活性，目前只適用于物種是人的單細胞數據。作者...
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一文學會單細胞轉錄組的CellRanger（一）一、什么是Cell Ranger？ Cell Ranger 是一組分析管道，用于處理 Chromium 單細胞數據，將fastq原始數據經過比對...
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ChIP-Seq——MAnorm差異分析
一、 MANorm介紹 MAnorm是一個穩健的模型，用于定量比較 TF（轉錄因子）或表觀遺傳修飾的 ChIP-Seq 數據集。MAnorm 使...
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單細胞免疫組庫VDJ——scRepertoire （四）一、介紹 scRepertoire 旨在從 10x Genomics Cell Ranger 管道中獲取過濾器 contig 輸出，處理該數據以...
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非模式物種KEGG富集數據庫準備（二）一、KEGG數據下載 1、先進入官網：https://www.kegg.jp/[https://www.kegg.jp/] 2、進入KO (KE...