IP屬地：云南
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R語言繪制組間比較散點圖并自動添加P值信息
查詢ggprism包使用時候發現官網給出的一示例圖比較常用，這里記錄學習一下。 加載R包準備數據 注意兩個細節： tools::toTitleC...
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利用abbrevr包批量輸出期刊縮寫有時候用endnote導入文獻后顯示的是期刊全稱，而用到縮寫時候就需要去一些網站上一個個搜索，比如CASSI[https://cassi.cas...
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利用massdatabase包提取物種KEGG通路與基因/化合物對應信息
最近手頭處理一批代謝組數據, 想基于幾十個關鍵差異代謝物代謝物進行下KEGG富集，能想到有兩種方式解決，一種常用方式就是基于MetaboAnal...
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基于GO-Figure快速繪制GO富集氣泡圖
GO-Figure! 是一個基于pyhton寫的GO富集小軟件，方便我們拿到富集結果后直接使用命令行的形式進行可視化，繪制出具有靈活性、可重復性...
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一個輕量級繪制熱圖的R包-HeatmapR
目前R中繪制熱圖的方式有很多，常用的如pheatmap、ComplexHeatmap包等，這里再給大家介紹一個輕量級的R包-HeatmapR包，...
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分級KEGG富集pathway圖繪制最近在基迪奧平臺上看到了這張KEGG富集信息圖，剛好手頭有批現成的轉錄組數據，剛好繪制一下給富集圖換換風格~~image.png 準備輸入文件 ...
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學會這三個包，搞定R中的正則天下苦正則久矣，尤其當字符串中有自己想要的一段數據時候苦苦提取不出來的感覺真是難受，今天給大家介紹3個R包來解決這種正則帶來煩惱的包，希望對大家...
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SFINX: 一個基于Shiny部署的鑒定蛋白互作關系平臺
目前研究蛋白質互作方法有很多，傳統的方法是將天然蛋白免疫沉淀與質譜檢測結合(CoIP-MS)，另外流行的還有親和純化/質譜法(AP-MS)，與C...
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Robust火山圖：一種含離群值的代謝組數據差異分析方法
代謝組學中差異代謝物的識別仍然是一個巨大的挑戰，并在代謝組學數據分析中發揮著突出的作用。由于分析、實驗和生物的模糊性，代謝組學數據集經常包含異常...