發簡信
IP屬地：福建
-
@賊菜但是想順利畢業
安裝python 模塊 pip install csvkit
然后csvcut -t -c 列名1,列名2 文件名| csvformat -T >ouputfile 注意：-t代表tab分割，
例子:
csvcut -t -c columnname1,columnname2 filename |csvformat -T >outputfile
這種方式也比較適合小文件，大文件速度會慢些??[linux]根據一串ID批量提取另外一個文件的指定行
一、待解決問題 A文件如下所示。tip:ID列指的是圖中帶紅框的那列,A大小73.1MB、B大小約1GBimage.png B文件是從網上下載的注釋文件"GCF_000001...
-
grep -w -f file1 file2會比較簡潔一點
如果file是在win底下構建的,最好使用 dos2unix file 來將換行符換成linux下的換行符??[linux]根據一串ID批量提取另外一個文件的指定行
一、待解決問題 A文件如下所示。tip:ID列指的是圖中帶紅框的那列,A大小73.1MB、B大小約1GBimage.png B文件是從網上下載的注釋文件"GCF_000001...
-
grep -w -f file1 file2會比較簡潔一點
如果file是在win底下構建的,最好使用 dos2unix file 來將換行符換成linux下的換行符??[linux]根據一串ID批量提取另外一個文件的指定行
一、待解決問題 A文件如下所示。tip:ID列指的是圖中帶紅框的那列,A大小73.1MB、B大小約1GBimage.png B文件是從網上下載的注釋文件"GCF_000001...
-
-
-
運行不通的緣故有可能是由于win和linux里的換行符不一樣（win傳過去的文件的換行符好像是^M）
real_id=`echo $id| cut -d"^" -f1`是只取win換行符前的部分，這行看情況用??[linux]根據一串ID批量提取另外一個文件的指定行
一、待解決問題 A文件如下所示。tip:ID列指的是圖中帶紅框的那列,A大小73.1MB、B大小約1GBimage.png B文件是從網上下載的注釋文件"GCF_000001...
-
grep -w 精確匹配
??[linux]根據一串ID批量提取另外一個文件的指定行
一、待解決問題 A文件如下所示。tip:ID列指的是圖中帶紅框的那列,A大小73.1MB、B大小約1GBimage.png B文件是從網上下載的注釋文件"GCF_000001...
-
人生幾何，何不Python當歌？學習Python之路，始于爬蟲，限于文本，忠于數據分析。目前文本和爬蟲剛剛入門，數據分析還未真正開始。<br>公眾號：Python攻城獅<br><br>博客地址：<a href="https://ask.hellobi.com/blog/zhiji" rel="nofollow" target="_blank">https://ask.hellobi.com/blog/zhiji</a><br><br>掘金：<a href="https://juejin.im/user/5a30fe44f265da4324807186" rel="nofollow" target="_blank">https://juejin.im/user/5a30fe44f265da4324807186</a><br><br>Github：<a href="https://github.com/ReainL" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/ReainL</a><br><br>大人不華，君子務實。<br>轉載請保留原文鏈接及作者。
-
收集一些生物信息學的分析流程的文章。感謝這些簡友整理的生信分析流程！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質免疫共沉淀技術ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預后標志物查找 ?? 系統發育演化進化樹構建與分析 ?? 群體遺傳學分析 ?? 全基因組關聯分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細節的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數據庫的挖掘方法，比如TCGA數據庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
-
???[R]從Github上輕松安裝R包④終極大招???[轉載][R]從Github上輕松安裝R包①—githubinstall包???[R]從Github上輕松安裝R包②補充???[R]從Github上輕松安裝R包③無法下載Gi...
-
[R|報錯解決]R語言non-zero exit status
一位師弟在服務器上安裝GSVA包時，依賴包 XML的安裝發生了錯誤non-zero exit statusnon-zero exit status 解決方法：我找了一臺已安裝...
-
我剛測試了一下，可以下載，你再搗鼓搗鼓看看
??⒅[神器-軟件]唧唧-批量下載B站視頻的神器
場景：某天你在B站看到了一個系列的教程，你想把它下載下來，然后在本地慢慢的看。 問題產生：一個一個下~好慢吶，我該怎么辦，我想批量下載 解決方案： 在這里你可以下載到對應的A...
-
[數據庫]常用生物醫學數據庫與分析軟件介紹參考資料：https://max.book118.com/html/2017/0727/124711768.shtm 先前在哈爾濱醫科大學生信培訓資料里看到了一張這樣的總結圖...
-
⑨??[目錄-文集類]生信數據庫文集~目錄------更新于20191217
哈醫數據庫①Lnc2Cancer、Lnc2Meth、LncACTdb、MSDD 哈醫數據庫②miRSponge、Co-LncRNA、FACER 哈醫數據庫③LncMAP、LN...
-
⑧??[目錄-文集類]R語言學習文集~目錄------更新于20191217
1.[轉載][R]從Github上輕松安裝R包—githubinstall包 2.[R]生物信息各類ID轉換攻略 3.[R]甲基化①ChAMP幫助文檔譯[上]-甲基化分析流程...
