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GATK(全稱The Genome Analysis Toolkit)是Broad Institute開發的用于二代重測序數據分析的一款軟件,里...
GFF (general feature format): 可以用于任何基因組注釋的存儲 GTF (gene transfer format):...
一、文件準備 基因組文件:r498.fa 與基因組對應的注釋文件:r498.gff (最好是gtf 格式,后續需要將gff 轉化為gtf ) v...
一、準備工具 兩個基因組文件: fs32.fa r498.fa (作為參考基因組) minimap2的安裝: 1.conda 直接安裝 con...
1.創建python3.5環境、安裝工具 conda create -n mutmap python=3.5 mutmap 2.準備文件 參考基...
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