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【原創(chuàng)】在NCBI查找指定物種基因組信息 生信分析中經(jīng)常需要查找指定物種的基因組信息。如:基因組相關(guān)分析中需要借助已有基因組輔助基因組組裝及基因...
【原創(chuàng)】生信分析常見(jiàn)文件格式說(shuō)明 生信分析中經(jīng)常會(huì)遇到各種格式特殊的文件,例如:fasta、gff、gtf、gbk、m8、sam/bam、vcf...
【原創(chuàng)】生信分析常用基因組數(shù)據(jù)庫(kù)匯總 一、綜合性基因組數(shù)據(jù)庫(kù) 1、NCBIAssembly 目前最常用的綜合性基因組數(shù)據(jù)庫(kù),沒(méi)有之一(畢...
1. VCF介紹 VCF是用于描述SNP,INDEL和SV結(jié)果的文本文件。在GATK軟件中得到最好的支持,當(dāng)然samtools得到的結(jié)果也是VC...
一、格式介紹 (一)gtf 文件。GTF 為General Transfer Format縮寫(xiě),跟 GFF2格式類似。相信大家做轉(zhuǎn)錄組分析時(shí)候經(jīng)...
生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù) Biology Databases -----------------------------------------------...