對于通路分析結果的可視化而言，最常用的展現方式就是在通路中高亮顯示富集到的基因。kegg 提供了在Color Pathway 在線服務，可以方便的完成這一任務。 網址如下： ...
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IP屬地：廣東
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color pathway 使用指南 : 在通路圖中標記基因
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KEGG API 用法詳解下篇
本篇接著介紹下列 4種 api 的用法： get conv link 4.ddi get 根據提供的kegg 標識符，返回特定的記錄，多個標識符之間用+ 連接，一次最多允許1...
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KEGG API 用法詳解上篇
對于大多數的數據庫而言，API接口可以方便的從數據庫中檢索數據。kegg 數據庫的API 鏈接如下： http://www.kegg.jp/kegg/rest/keggapi...
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KEGG pathway 數據庫
pathway 建立在ko 數據庫的基礎上，基于我們對生命活動中的分子相互作用和化學物質的反應的認識，構建了復雜的調控網絡，采用通路圖的形式，進行展示。 通路圖中融合了ko,...
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KEGG Glycan 數據庫
復合糖作為糖類與蛋白質或者脂質結合的產物 ，在生物中分布廣泛，具有重要的功能。GLYCAN 數據庫收錄了實驗驗證過的復合糖的信息，主要是結構信息。每條記錄用G number ...
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KEGG Genes 數據庫
kegg genes 數據庫收錄了物種的基因信息。 kegg 使用自己定義的ID 唯一區別每個基因，叫做kegg gene ID。 對于每個基因，除了給出對應的物種，染色體...
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KEGG Genome 數據庫
kegg Genome 由organisms，selected viruses 和 Metagenomes 3個數據庫構成。 kegg Organisms 數據庫收錄了有完整...
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KEGG Drug 數據庫
kegg drug 數據庫是一個藥物相關信息的綜合數據庫，包括了在日本，美國，歐洲上市的的藥物。所有在日本上市的藥物，不論處方藥還是非處方藥，包括天然藥物和中藥，都會在Dru...
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KEGG Network 數據庫
kegg orthology 數據庫是 kegg 的核心，利用基因在不同物種之間的保守性，使得我們可以在更高層次上解讀基因功能。 pathway, brite, module...
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KEGG Disease 數據庫
kegg disease 數據庫收錄了已經報告的各種疾病的信息，每個記錄用H Number 唯一標識， 比如H00004。 在kegg 中，將疾病視作分子網絡的一個不正常的狀...
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KEGG Reaction 數據庫
KEGG Reaction 是收錄酶促反應相關信息的數據庫，包含了所有代謝通路中的酶促反應和一些只在enzyme 數據庫中有記錄的酶促反應，每條記錄用R Number 唯一標...
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KEGG Enzyme 數據庫
生物體內的大多數反應都需要酶的參與，酶在生命活動中發揮了重要作用。IUBMB/UPAC 國際標準化命名委員會對已經發現的酶都提供了標準化的的命名方式，叫做EC number。...
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KEGG COMPOUND 數據庫
kegg compound 數據庫存儲了在生命活動中發揮作用的各種小分子，生物大分子和其他類型的化學物質，采用C number 進行標識，比如C00047, 代表L-賴氨酸...
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KEGG Orthology 數據庫簡介
我們經常會使用KEGG數據庫來研究基因的功能，而在KEGG 數據庫中，直接存儲分子功能的就是KEGG Orthology 數據庫。 KEGG Orthology 簡稱KO,該...
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KEGG Brite 數據庫
KEGG被稱為京都基因組百科全書，是一個綜合性的數據庫。對于如此龐大的數據庫，肯定需要對數據進行分門別類的整理。除了將各種數據拆分到不同的子數據庫中之外，KEGG還對所有的數...
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KEGG Module 數據庫
具有相同功能的基因被歸類到kegg orthology 中，每個KO 代表具體的一個功能。在生命活動中，往往需要多個功能單位共同發揮作用，比如多個蛋白質構成復合體來發揮調控作...
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如何做火一個微博賬號這是我在V峰會的演講內容 分享給大家，恩，沒什么好保留的，好的模式，不怕公開 以下是演講全文： 大家好，我要開始裝逼了！ 在座的各位應該都不認識我，就算認識的出了這個門估計也...
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Disease Ontology:人類疾病分類數據庫
歡迎關注”生信修煉手冊”! Gene Ontology, 簡稱GO, 是最常用的基因功能注釋數據庫之一。Disease Ontolog與GO數據庫類似，通過參照MeSH, I...
