轉錄組和染色質可及性在單個細胞內的聯合分析允許解構轉錄狀態與決定不同細胞命運的上游調節程序之間的復雜關系。在這里，我們開發了一種自動化的方法，具有很高的靈敏度，可檢測單細胞轉錄組和可及區域（ASTAR-seq），以便同時測量同一單個細胞內的全細胞轉錄組和染色質可及性。為了顯示ASTAR-seq的效用，我們分析了384個mESC在原始和多能全能狀態以及兩細胞樣狀態，424種不同譜系起源（BJ，K562，JK1和Jurkat）下的人類細胞，480個原代臍血細胞進行成紅細胞分化。通過聯合配置文件，我們配置了離散細胞狀態的轉錄和染色質可及性圖譜，并發現了順式調控元件和每個基因特有的靶基因，并構建了以相互作用組和轉錄因子（TF）為中心的各種細胞狀態的上游調控網絡。
參考文獻：https://genome.cshlp.org/content/early/2020/07/22/gr.257840.119.short?rss=1
