P1 優先選擇二進制可執行軟件來安裝
不同組學任務模塊
比對重要
全基因組測序/外顯子測序 找差異和變異
轉錄組相關計數
軟件安裝規律：
- 二進制，下載 解壓，全路徑調用
#C語言查看在還是不在
which make
which cmake
which java
which perl
which python
#查看版本
python --version
perl --version
查看版本，版本問題導致錯誤
如何判斷所有軟件是否是二進制，進入軟件官網查看，例子fastqc
右鍵復制下載鏈接
每個軟件都有一個文件夾
find ./-name ""*gz #找壓縮包,自帶測試數據，軟件會相互依賴，會有打包軟件
mkdir biosoft
cd biosoft/
ls
mkdir fastqc
wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.8.dmg
history |grep fastqc #歷史記錄中搜索fastqc
which fastqc
/usr/bin/fastqc #需要root權限
touch tmp #創建一個空的文件夾來查看是否在/usr/bin/ 下有root權限
touch; cannot touch 'tmp':Permission denied
sudo touch tmp #獲得root權限創建新的空文件
sudo rm tmp #用root權限刪除tmp文件
