pandas讀取csv文件數據的方法及注意點

pandas是一個高效的數據分析工具。基于其高度抽象的數據結構DataFrame點擊這里了解DataFrame數據結構),幾乎可以對數據進行任何你想要的操作。

由于現實世界中數據源的格式非常多,pandas也支持了不同數據格式的導入方法,本文介紹pandas如何從csv文件中導入數據。

數據導入到pandas

從上圖可以看出,我們要做的工作就是把存儲在csv格式中的數據讀入并轉換成DataFrame格式。
pandas提供了一個非常簡單的api函數來實現這個功能:read_csv()

1. 通過read_csv接口讀入csv文件中的數據

下面是一個簡單的示例:

import pandas as pd

CSV_FILE_PATH = './test.csv'
df = pd.read_csv(CSV_FILE_PATH)
print(df.head(5))

只要簡單地指定csv文件的路徑,便可以得到DataFrame格式的數據df。對于理想情況下的數據,導入過程就是這么簡單!

下面考慮這種情況:假設csv文件頭部有幾個無效行,那么打印出來的結果可能如下所示:

                      1          2      3       4
0             datetime       host    hit  volume
1  2018-07-24 09:00:00  weibo.com     20    1020
2  2018-07-25 09:00:00     qq.com  no 20    1028
3  2018-07-26 19:00:00   sina.com     25    1181
4  2018-07-27 21:00:00   sohu.com     15    4582

pandas把【1,2,3,4】這組無效數據當作了column name;而實際上,我們更偏向于將【datetime,host,hit,volume】這組數據當作column name。對于這種情況,read_csv()函數提供了一個參數:skiprows,用于指定跳過csv文件的頭部的前幾行。在這里,我們跳過1行即可。

import pandas as pd


CSV_FILE_PATH = './test.csv'
df = pd.read_csv(CSV_FILE_PATH, skiprows=1)
print(df.head(5))

得到的結果如下所示:

              datetime       host    hit  volume
0  2018-07-24 09:00:00  weibo.com     20    1020
1  2018-07-25 09:00:00     qq.com  no 20    1028
2  2018-07-26 19:00:00   sina.com     25    1181
3  2018-07-27 21:00:00   sohu.com     15    4582

2. 處理csv文件中的無效數據

pandas可以自動推斷每個column的數據類型,以方便后續對數據的處理。還以上文中的數據為例,通過如下代碼:

import pandas as pd


CSV_FILE_PATH = './test.csv'
df = pd.read_csv(CSV_FILE_PATH)
print(df.head(5))
print('datatype of column hit is: ' + str(df['hit'].dtypes))

得出的結果:


              datetime       host  hit  volume
0  2018-07-24 09:00:00  weibo.com   20    1020
1  2018-07-25 09:00:00     qq.com   20    1028
2  2018-07-26 19:00:00   sina.com   25    1181
3  2018-07-27 21:00:00   sohu.com   15    4582
datatype of column hit is: int64

pandas將hit這一列的數據類型判定為了int64,這顯然方便未來我們對于該列數據的運算。
但是在實際情況中,我們經常會面臨數據缺失的問題,如果出現這種情況,我們往往會用一些占位符來表達。假設,我們用missing這個占位符來表示數據缺失,仍使用上述代碼,來探索下會發生些什么:

              datetime       host      hit   volume
0  2018-07-24 09:00:00  weibo.com       20     1020
1  2018-07-25 09:00:00     qq.com       20     1028
2  2018-07-26 19:00:00   sina.com  missing  missing
3  2018-07-27 21:00:00   sohu.com       15     4582
datatype of column hit is: object

由于hit這一列中出現了missing這個字符串,pandas將hit這一列的數據類型判斷成了object。這會給我們對該列數據的運算帶來影響。例如,假設我們要計算hit列前兩行數據的和,代碼如下:

print(df['hit'][0] + df['hit'][1])

結果是:

2020

本來我們想要的是數學運算結果,但得到的卻是一個字符串拼接結果。這就是由于數據類型判斷失誤帶來的嚴重影響。
對于這種情況,read_csv()函數也提供了一個簡單的處理方式,只需要通過na_value參數指定占位符,pandas便會在讀入數據的過程中自動將這些占位符轉換成NaN,從而不影響pandas對column數據類型的正確判斷。
示例代碼:

import pandas as pd
  
  
CSV_FILE_PATH = './test.csv'
  
df = pd.read_csv(CSV_FILE_PATH, skiprows=0, na_values=['missing')
print(df.head(5))
print('datatype of column hit is: ' + str(df['hit'].dtypes))
print(df['hit'][0] + df['hit'][1])

運行結果如下:

              datetime       host   hit  volume
0  2018-07-24 09:00:00  weibo.com  20.0  1020.0
1  2018-07-25 09:00:00     qq.com  20.0  1028.0
2  2018-07-26 19:00:00   sina.com   NaN     NaN
3  2018-07-27 21:00:00   sohu.com  15.0  4582.0
datatype of column hit is: float64
40.0

可以看到,pandas將數據集中的missing單元全部轉換為了NaN,并成功判斷出hit這一列的數據類型。

3. 總結

通過一個簡單的read_csv()函數,實際可以做到如下幾件事:

  • 通過指定的文件路徑,從本地讀取csv文件,并將數據轉換成DataFrame格式
  • 更正數據集的頭部(column)
  • 正確處理缺失數據
  • 推斷每一列的數據類型

當然,read_csv()函數還有一系列其他參數來應對各種情況,遇到具體問題的同學可參考其接口指南。

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