DVC數據管理

圖1. DVC流程示意圖

DVC通過生成.dvc文件來追蹤數據集,可以把這個.dvc文件理解成鑰匙,找到了鑰匙也就可以打開寶藏(目標數據集),而過多的.dvc文件又容易造成混亂,因此引入git來管理.dvc文件,也就是說git并不是在管理寶藏,而是在管理鑰匙,真正的寶藏放在了“remote”所指向的位置,也就是我們的“寶藏”倉庫,這個倉庫就是DVC所支持的各種存儲方式,如本地存儲、s3存儲、ssh存儲等。DVC工作邏輯圖上圖:

1. DVC原理

DVC即data version control, 是一種針對人工智能項目(機器學習或者深度學習)的數據版本管理工具。DVC的操作和GIT類似,可以認為為GIT的二次開發封裝。結合GIT,DVC可以有效的管理人工智能項目的整個流程,包括代碼,數據,訓練配置,模型。

GIT和DVC分工如下:

  • DVC:負責數據和模型等大文件的存儲、下載等管理,同時生成元數據(.dvc文件)描述這些數據和模型, 并且串聯整個人工智能項目工作流
  • git:負責代碼和DVC生成的元數據文件的版本管理
圖2. DVC數據存儲
圖3. DVC數據拉取

2. DVC操作

實驗環境:Ubuntu 20.04.3 LTS

2.1 DVC安裝
pip install dvc==3.42.0
2.2 數據版本管理
# 到git目錄下
git config --global user.name "xxxx"
git config --global user.email "xxxx@wedo.com"
git clone ssh://git@101.81.238.21/test/test.git
cd test/

# dvc 初始化
dvc init
# 將dvc 初始化的文件提交 git
git commit -m "Initialize DVC"

# 初始化后會在項目目錄下生成.dvc文件夾,存儲dvc相關的信息
.dvc
├── config
├── plots
│   ├── confusion.json
│   ├── default.json
│   ├── scatter.json
│   └── smooth.json
└── tmp
    └── index
2.3 添加數據

可以通過dvc add/git add將數據和模型添加到版本管理中

# 假設數據在arch_train/model_zoo/nsfw_online_err.zip
dvc add arch_train/model_zoo/nsfw_online_err.zip
git add arch_train/model_zoo/.gitignore arch_train/model_zoo/nsfw_online_err.zip.dvc


# .dvc 后綴為數據的元數據文件,默認為存儲路徑為.dvc/cache下
cat arch_train/model_zoo/nsfw_online_err.zip.dvc
outs:
- md5: 26eb560df48bf11ddf303135749b0c60
  path: nsfw_online_err.zip

.
├── cache
│   └── 26
│       └── eb560df48bf11ddf303135749b0c60
2.4 版本切換管理

可以配合git的分支管理,來獲取分支下不同的數據和模型

# 切換分支
git checkout 分支名

# dvc通過git中的.dvc 文件,切換這個分支下數據
dvc checkout
2.5 共享代碼 push or pull

當多人開發時,dvc push會根據config中的遠程主機配置,將數據push到遠程主機。遠程主機可以是ssh,http還有云盤存儲等

# 建立 遠程服務 ssh或者http
# 這里以本地的其他目錄為例子
mkdir -p /tmp/dvc-storage
dvc remote add -d myremote /tmp/dvc-storage
git commit .dvc/config -m "Configure local remote"
# 新建后 就會在`.dvc/config`存儲遠程主機訪問的方式
vim config 
[core]
    remote = myremote
['remote "myremote"']
    url = /tmp/dvc-storage

# dvc push 上傳數據
dvc push

# 遠程主機中數據是上傳的一個備份
tree /tmp/dvc-storage/
/tmp/dvc-storage/
└── 26
    └── eb560df48bf11ddf303135749b0c60

1 directory, 1 file
ls -l  /tmp/dvc-storage/26
total 93400
-r--r--r-- 1 root root 95640298 Sep  4 13:44 eb560df48bf11ddf303135749b0c60
ls -lh  /tmp/dvc-storage/26
total 92M
-r--r--r-- 1 root root 92M Sep  4 13:44 eb560df48bf11ddf303135749b0c60

如果數據變更,同樣dvc+git進行版本管理

# 數據變化
dvc add arch_train/model_zoo/nsfw_online_err.zip
git commit arch_train/model_zoo/.gitignore arch_train/model_zoo/nsfw_online_err.zip.dvc -m "Dataset updates"
dvc push

當其他人想使用共享代碼和數據時 git clone + dvc pull

# 下載代碼和數據.dvc
git clone ssh://git@101.81.238.21/test/test.git
cd test/

# 根據.dvc和config遠程主機配置,下載對應的數據和模型
dvc pull 
2.6 串聯工作流

git的操作基本上吻合的,原理上可以和git對等。可以通過dvc run來建立訓練和評估過程的依賴關系,即將輸入的數據,預訓練的模型,配置和輸出的模型和訓練腳本關聯起來,可以很方面追溯執行過程, 每次關聯dvc都會生成一個yaml配置來描述這個關聯性。dvc run的主要參數如下:

  • -n:操作的名稱
  • -p:配置,可以是多個,文件或者文件夾
  • -d:操作依賴的數據,腳本和模型等,可以是多個,文件或者文件夾
  • -o:操作的輸出,可以是多個,文件或者文件夾
  • command:執行操作的命令如python -u train.py
# example
dvc run -n prepare \
          -p prepare.seed,prepare.split \
          -d src/prepare.py -d data/data.xml \
          -o data/prepared \
          python src/prepare.py data/data.xml

3. 總結

dvc把數據、模型、算法腳本和Metrics當成一次代碼checkout,配合git就可以很方面的管理每一次訓練的所有環節,還可以通過dvc metrics show -T來比較不同版本的模型性能。更多詳細的dvc功能參見https://dvc.org/doc/start;歡迎交流討論。總結如下

  • dvc add/push/pull 管理數據
  • dvc run 管理工作流串聯
  • 建議一個模型迭代一個分支,該分支囊括代碼,數據,模型,配置, 模型評估;可以完美迭代模型優化。
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