作圖是一直是科研工作的一項重大工程,可以說是一篇文章的門面擔當!
好看的圖表
不僅可以優雅地展示數據,闡述實驗結果
可以迷惑同行評議,提升文章的檔次
還可以獲得同學的仰慕,提升交際能力
甚至可以賞心悅目,讓你的多巴胺點亮科研靈感,早日登上諾獎領獎臺。
在這個看臉的世界,無論是論文中的科研圖表,還是給老師匯報的PPT,都得講究顏值與才華兼顧。
比如下面這位朋友,由于作圖太丑,欲語淚先流!
科研作圖是如此的重要,趁手的兵器(作圖工具)自然是需要好好挑選!
目前常見的科研作圖軟件有以下幾種:
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OriginLab
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GraphPad Prism
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Python、R
這三種工具,都可以完成非常專業且好看的圖,且1和3本人都在使用。
Python和R畫圖需要編程,強大到只有想不到,沒有做不到,也強大到沒幾個月的學習你根本啥都畫不出來。
OriginLab操作相對簡單,但也有非常多的細節需要注意,而且我認為這個軟件對于不同圖表的畫圖邏輯并不統一,在做復雜的圖或者多圖拼接時,總體感覺不夠靈活。愛真的需要勇氣。
以上工具用的好,都非常強大,但較高的學習成本導致了較低的性價比。
所以,有沒有那么一個軟件,能像孫大圣的金箍棒一樣,靈活而強大呢
Excel,
值得我們托付終身的畫圖利器!
EXCEL 科研繪圖
我常常見一些同學,畫柱狀圖, 一定要用OriginLab來畫,結果一頓操作,也搞不出想要的效果。 別忘了,我們還有Excel!
EXCEL不是專門為科研作圖而生,他的畫圖功能也并沒有非常強悍,
但是EXCEL有著較低的學習成本(不等于沒有)和超級友好的交互界面,熟練使用,絕對可以應付大多數的數據可視化工作。
我們以柱狀圖為例,看看EXCEL可以完成怎樣的效果。
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大氣臻黑版
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樸素低調版
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幻彩青春版
動態展示版
當你有許多個因素,不同水平的數據時,可以使用power pivot 和Slicer,
可以快速查看不同實驗條件之間的變化趨勢
核心科技
好看的科研圖表,其實和工具無關,和圖表本身的設計有關,使用不同工具,只是便捷程度不同而已。
科研作圖核心科技:
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字要大, 字要大, 字要大
科研圖表由于一般圖很小(單column的圖只有3inch左右),為了保證打印出來可以簡單清晰的看懂圖表,要求文字一定要大,線一定要粗。而且不是文字本身要大,而是它相對于整個圖片比例要大,才能獲得大氣、清晰的科研質感!
- 科研圖表的配色一般都很正式,除了生物信息學和統計學會有花里胡哨色彩斑斕的圖表外,簡單的圖表都非常喜歡黑白、灰階配色,原因可能是打印出來醒目,易讀,且不受黑白打印的限制。
實例操作
實不相瞞,Excel本身在科研類型的圖表制作方面并不強大,不過,有科研屆的大牛看不下去了,專門寫了Excel插件,不僅實現了300dpi的圖片導出,還可以快速應用科研圖表樣式,給你的圖表瞬間換裝!
現在,我們就來體驗一下Excel和這個插件的魅力
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準備數據
比如我要檢測AB兩種情況下G1、G2、G3這三個基因的表達量,每個實驗三個平行,數據如下
注意:這里,我們不需要進行任何統計,實驗的平行不需要統計平均值和標準差,統計的事,交給下一步 使用Pivot Table統計
PivotTable是個Excel中比較好用的數據重塑與統計的功能,可以自動將數據分塊統計。
上圖中,Pivot Table就將不同的Condition 和 Gene的數據分組 , 求取每組的平均值,同理,我們還可以求標準差等!我之前的寫的qPCR自動計算程序
就很大程度上依賴于這個功能
這里演示一下整個統計過程:
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出圖
這里首先使用Excel畫個圖,然后使用大佬的Excel插件把我們的圖片打扮成大人模樣!而且還能靈活篩選,動態變化!
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導出
一鍵出圖, 可導出300dpi的圖片,滿足出版需求。不僅可以單個導出,而且還可以批量導出,自動命名!
結語
神奇的時光總是很短暫,Excel和科研繪圖插件的介紹也接近尾聲,除了圖標風格的設置,高質量的圖標的導出,這個插件還有方差分析(ANOVA),線性回歸(Linear Regression)等貼心統計功能。對于廣大的科研工作者,簡直香氣四溢!
利用好Excel和他的周邊,不斷探索新功能,無論是科研還是辦公領域,都可以讓你有不一樣的體驗!
說了這么多,心動了嗎,趕快在“小折線”微信公眾號后臺回復
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2020-07-05
Shawn