講解人：劉綿宇

5.1 框架

摘要的結(jié)構(gòu)和內(nèi)容近幾十年來發(fā)生了變化。在《科學(xué)引文索引》等在線出版數(shù)據(jù)庫出現(xiàn)之前，摘要被打印在研究文章的頂部，其功能主要是鼓勵讀者繼續(xù)閱讀文章，并通過提供簡短的預(yù)覽來促進閱讀。讀者和作者都不把研究論文的摘要看作一個獨立的單元，因為通常不參考文章本身就不會閱讀摘要。

互聯(lián)網(wǎng)已經(jīng)影響了科學(xué)研究的交流方式和科學(xué)家獲取已發(fā)表研究的方式。摘要數(shù)據(jù)庫允許科學(xué)家搜索和掃描科學(xué)文獻，然后決定他們想詳細閱讀哪些研究文章。有些讀者只想知道他們研究領(lǐng)域的情況，可能對細節(jié)不感興趣；另一些讀者可能想知道細節(jié)，但只對與自己研究直接相關(guān)的研究文章感興趣。然而，如果讀者真的要閱讀你的研究文章，那么現(xiàn)在需要說服他們獲取一份（下載一份?），而不僅僅是鼓勵他們繼續(xù)閱讀他們已經(jīng)閱讀過的論文。

摘要得在聯(lián)機數(shù)據(jù)庫中爭奪注意力。讀標題的人比讀摘要的人多，讀摘要的人比讀整篇論文的人多。這意味著無論摘要寫得多么好，它都需要有獨立的有效性，并且作為一篇獨立、自成體系的研究文章描述應(yīng)該是有意義的，讀者應(yīng)該能夠理解研究的重點和結(jié)果，即使他們從來沒有看到整篇文章。從這個意義上說，摘要是研究文章的一種表現(xiàn)形式。

為什么摘要單元在這本書的結(jié)尾而不是開頭？

首先，摘要的風(fēng)格和篇幅取決于你打算在哪里提交，而這個決定可能在寫作過程中后期甚至是后期做出。然而，把這個單元放在本書結(jié)尾的摘要上的最重要的原因是：在你完成論文的其他部分之后，你可以更好地創(chuàng)建一個摘要。摘要的內(nèi)容來源于文章的其余部分，而不是其他途徑。不可以簡單地從文章的正文中截取一整句話，但摘要中不應(yīng)包含論文中沒有的材料。這意味著你不需要創(chuàng)建完全新的句子；一旦你決定了什么應(yīng)該進入摘要，你就可以從論文的相關(guān)章節(jié)中選擇材料，包括句子和短語的一部分，并對其進行調(diào)整或修改，以滿足摘要的要求。這也意味著摘要比論文的其他部分更容易寫！

每一個摘要都應(yīng)該遵循相同的模式嗎？

不，摘要的標題反映了這一點。有的叫Summary，有的叫Background，有的叫Abstract，有的根本沒有標題。大多數(shù)摘要是以結(jié)果為中心的，在所有的摘要中都有基本的相似之處，但是有兩個截然不同的模型。第一個模型類似于一個總結(jié)，并且非常結(jié)構(gòu)化。它涉及研究文章的所有主要部分，甚至可以有如下副標題 Background/Method/Results/Conclusions.

第二個模型更為常見，主要集中在研究的一個或兩個方面，通常是(并不總是)results和method。
這里將討論這兩種模型。注意，這里描述的摘要模型適用于文章、論文、論文等。會議摘要可能不遵循這兩種模型中的任何一種。

我怎么知道選擇那個模式？

這個取決于你所做的研究類型和你想要發(fā)表研究的期刊作者指南。這個決定通常由期刊來決定而不是作者。如果你來決定，那么一般來說，你的研究方向越窄，越具體，你使用摘要格式的可能性就越小。這是因為在一個狹隘的研究領(lǐng)域，大多數(shù)讀者已經(jīng)知道了背景。每個期刊設(shè)置的字數(shù)限制對摘要的結(jié)構(gòu)和內(nèi)容也有很大的影響。

我們來問三個問題：

?如何開始摘要？我應(yīng)該以什么類型的句子開頭？
?什么類型的信息應(yīng)該是摘要的，并且以什么順序排列？
?如何結(jié)束本節(jié)？

已經(jīng)知道很多關(guān)于抽象應(yīng)該包括什么和以什么順序。
下面是這兩種模型的示例。請注意，模型2摘要比模型1更常見。

本文的標題是：Physical properties of petroleum reservoir fl uids derived from
acoustic measurements.。不要擔心你對bubble之類的術(shù)語有難以理解的地方。試著在這個階段得到一個大致的了解，并熟悉自己的結(jié)構(gòu)。

模型一

model1

摘要：液體中的聲速是由液體的熱力學(xué)性質(zhì)決定的，因而也是液體熱力學(xué)性質(zhì)的一個指標。本研究的目的是探討利用超聲波電池測定原油性質(zhì)，特別是原油密度的方法。構(gòu)建了一個超聲波傳感器來測量聲速，并在原油樣品中進行了測試。在260到411k的溫度下，在75mps的壓力下測量了聲速，結(jié)果表明，這種測量可以精確地測定油的起泡點。這表明有可能從聲速測量中獲得液體密度，并表明有可能用超聲波傳感器測量吸聲量來確定油的粘度。

現(xiàn)在看看第二種，更常見的摘要例子。本文的題目是：Eff ect of polymer coatings on drug release.（高分子涂層對藥物釋放的影響。）

model2

5.2語法和寫作技巧

因為摘要是從文章的其他部分派生出來的，所以大部分語法和寫作技巧已經(jīng)在前面的單元中介紹過了。然而，動詞時態(tài)的使用在摘要中是非常重要的。這一節(jié)還討論了摘要的長度和語言。

5.2.1動詞時態(tài)

動詞時態(tài)在摘要中尤其重要，因為嚴格的詞匯量限制意味著你可能需要省略一些短語，這些短語包括告訴讀者你指的是誰的工作，或者你對你的結(jié)果有什么看法。這種情況，可以通過仔細和準確地使用動詞時態(tài)來實現(xiàn)。
你在一個句子中使用的時態(tài)可能在語法上是正確的，也不會引起編輯或校對人員的注意，或引起你的注意，但你沒有選擇適當的時態(tài)，這個句子將意味著它沒有表達出你想表達的意思，也不會有你期待的效果。

差別或者問題通常用現(xiàn)在時：

The main problem, however, is…
然而，主要的問題是…
We examine why these models have difficulty with…
我們研究了為什么這些模型隊...有困難
However, this assumption is not valid when…
然而,當...這種假設(shè)是無效的···
This is complicated by…
因為···變得復(fù)雜
However, this assessment cannot be based solely on…
然而，這種評估不能僅僅基于····
Although it is known theoretically that…
雖然理論上知道…

當你提及論文干了什么，或者實際論文本身，用一般現(xiàn)在時。例如：
Th is paper presents a new methodology for…
本文為...提出了一種新的方法
In this paper we apply…
在這篇文章中，我們采用了···
This study reports an improved design for…
這個研究報道了一個關(guān)于···的改進設(shè)計
In this paper we extend an existing approach to…
本文將現(xiàn)有方法推廣到···
We consider a novel system of…
我們創(chuàng)造了一個關(guān)于···的新系統(tǒng)
The implications for learning algorithms are discussed…
這個學(xué)習(xí)算法的含義在···討論
New numerical results are presented here for…
本文給出了···的新數(shù)據(jù)結(jié)果

當你提到你的方法，或者你在研究期間所做的事情時，通常使用一般過去時，例如：
Two catalysts were examined in order to…
為了···，驗證了兩種催化劑
Samples were prepared for electron microscopy using…
準備電鏡的樣本來···
A crystalliser was constructed using…
一個結(jié)晶器被制造出用來···
The effect of pH was investigated by means of…
通過···驗證了PH值的影響
The data obtained were evaluated using…
使用···評估獲得的數(shù)據(jù)
A permeameter was used to investigate…
滲透儀用于研究···

也可以用一般現(xiàn)在時來討論你的方法，特別是當你提到在論文本身中能找到的計算或方程式的時候。

Numerical examples are analysed in detail…
數(shù)值示例進行了···的分析
The calculated wavelengths are compared to…
將計算出的波長與···比較
Several models are created using…
使用···創(chuàng)建模型
The accuracy is evaluated by…
這個準確度是由···評估的
A detailed comparison is made between…
詳細比較了…
The method is illustrated on blends of homopolymers…
該方法在均聚物共混體系中得到了應(yīng)用…

結(jié)果可以用一般現(xiàn)在時態(tài)表示，例如：
We find that oxygen reduction may occur up to 20 microns from the
interface…
我們發(fā)現(xiàn)···
The model consistently underpredicts…
這個模型一直低估了···
The ratio shifts towards…
比例趨向···
We show that this theory also applies to…
我們證明該理論也適用于···
The most accurate readings are obtained from…
最準確的讀數(shù)來自于···
We find that this does not vary…
我們發(fā)現(xiàn)···并沒有很大的變化
These examples illustrate that overpotential is better described in
terms of…
這些例子說明，用...可以更好地描述···。

或者，在更多情況下也可用一般過去時：
The Y-type was found to produce…
發(fā)現(xiàn)··會產(chǎn)生···
The hydrocarbons showed a marked increase in…
碳氫化合物顯示出明顯的增加在···
No dilation was observed…
沒有發(fā)現(xiàn)…
Th is was consistent with…
這與···一致
Organised fibers were found after 6 weeks…
6周后發(fā)現(xiàn)有組織的纖維…
These profiles were affected by…
這些···受···影響
This finding correlated with…
這一發(fā)現(xiàn)與···有關(guān)

也可以兩種時態(tài)混用，即句子的第一部分是一般過去式（We found/It was found ect.）
如果您認為您的發(fā)現(xiàn)/結(jié)果本身足夠明顯或其含義足以認定是事實，則可以表示為一般現(xiàn)在時：
The experiments demonstrated there are two matrices…
實驗證明了存在兩種基質(zhì)···
It was found that proteins are produced from…
發(fā)現(xiàn)了蛋白質(zhì)是由···產(chǎn)生的
The results demonstrated that the morphology is different…
結(jié)果表明形態(tài)是不同的…
This image suggested that there is a direct relationship between…
該圖像表明……之間存在直接關(guān)系。

如何選擇時態(tài)在 Introdutions（Section 1.2.1）和 Results（Section 3.4.2）中就有討論。除此之外，更應(yīng)該注意的是摘要傾向于以直接的方式呈現(xiàn)論文內(nèi)容， 不僅是因為編輯強加的字數(shù)限制，也是為了吸引讀者。這就使我沒決定用一般現(xiàn)在時來陳述結(jié)果或含義，盡管這些含義已經(jīng)在它的文章中用一般過去時陳述過了。

Achievements可以用現(xiàn)在完成時來表示，如Discussion/Conclusion 中：
We have obtained accurate quantitative LIF measurements…
我們已經(jīng)獲得了準確的定量LIF測量···
This investigation has revealed that…
···調(diào)查顯示···
We have devised a strategy which allows…
我們已經(jīng)設(shè)計出一種策略，允許……
We have demonstrated the feasibility of this approach by…
我們通過……證明了這種方法的可行性。
A novel material has been produced which…
產(chǎn)生了一種新穎的材料，它...
Three-dimensional FE predictions have confi rmed that…
三維有限元預(yù)測已確認...
Considerable insight has been gained concerning…
已經(jīng)獲得有關(guān)……
以及一般現(xiàn)在時態(tài)：
This process can successfully be combined with…
過程可以成功地與……相結(jié)合
The framework described here is both simple and universal…
這里描述的框架既簡單又通用……
The value of our approach lies in…
我們方法的價值在于……
This provides a powerful tool for…
提供了一種強大的工具，可以……
This novel film is mechanically robust and is able to…
新穎的薄膜具有機械堅固性，并且能夠…
The algorithm presented here ensures that…
這里介紹的算法可確保……

Applications 通常用一般現(xiàn)在時表示：
This process is suitable for the production of…
該工藝適合生產(chǎn)...
This framework can be used to evaluate…
該框架可用于評估…
This approach can be applied to…
這種方法可以應(yīng)用于…
This demonstrates potential for general applicability to…
這證明了普遍適用于……的潛力
These profiles may serve as a predictor for…
這些特性可以作為……的預(yù)測指標
This framework can be used to evaluate…
該框架可用于評估…

5.2.2 長度

摘要通常有嚴格的字數(shù)限制。大多數(shù)限制在80-150個單詞，并作為一個段落編寫。甚至更長的摘要（150-250字）也寫為一個段落。不要提交超過字數(shù)限制的摘要，否則摘要可能會被編輯亂刪。

對于初稿，不用太擔心字數(shù)限制。先確定將要使用的兩種摘要模型中的哪一種，就從包含您認為重要的內(nèi)容開始，然后逐步刪除不必要的單詞，短語甚至句子。

5.2.3語言

人們尋找文章可能會搜索短語和關(guān)鍵字。確保這些確切的單詞或短語出現(xiàn)在您的摘要中，以便你的文章較容易檢索出。
為了吸引更多的讀者，摘要不需要像文章本身那么專業(yè)，因為你的很多讀者并不清楚你寫出的一些專業(yè)術(shù)語和英文縮寫。可以在摘要中使用首字母縮寫詞，縮寫詞或技術(shù)術(shù)語，但首先應(yīng)說明其含義或代表什么。例如：
Granules of hydroxyapatite (HA) were implanted.
植入羥基磷灰石（HA）顆粒。

5.3 寫作任務(wù)：建立模型

5.3.1建立模型

您現(xiàn)在可以通過在下面提供的空白處寫出作者在每個句子中所做的簡短描述來構(gòu)建摘要的模型。這次相對容易，因為摘要的所有組件都在前面的小節(jié)中介紹過。和以前一樣，答案位于下一頁

指導(dǎo)方針

此時您需要構(gòu)建兩個模型來涵蓋兩種類型的摘要。您只需花10至20分鐘的時間就可以完成此任務(wù)，因為您以前的單位對句子類型很熟悉。不要忘記，您的模型只有在可以轉(zhuǎn)移到其他摘要時才有用，所以不要包含內(nèi)容詞，否則您將無法使用模型來生成自己的摘要。

記住，找出作者在句子中所做的事情，而不是他/她在說什么的一種方法是，假設(shè)您的計算機意外刪除了它。當它消失時，您作為讀者來說有什么變化，如果您按計算機上的另一個鍵，句子又回來了，這對您反應(yīng)信息的方式有什么影響？

如前幾節(jié)所述，弄清楚作者正在做什么的另一種方法是查看語法和詞匯線索。主要動詞的時態(tài)是什么？該時態(tài)通常用于什么？它與前一句的時態(tài)相同嗎？如果不是，作者為什么改變了時態(tài)？作者選擇使用哪些詞？

完成的時候，您可能會發(fā)現(xiàn)您生成了完整的模型，但是當您將它們與目標文章中的摘要編寫方式進行比較時，您可能仍會修改它們，尤其是第二種類型。

背景

Salmon Rickettsial Syndrome (SRS) caused by Piscirickettsia salmonis is a major disease affecting the Chilean salmon industry.
鮭魚立克次氏體綜合征（SRS）是影響智利鮭魚產(chǎn)業(yè)的主要疾病。
Genomic selection (GS) is a method wherein genome-wide markers and phenotype information of full-sibs are used to predict genomic EBV (GEBV) of selection candidates and is expected to have increased accuracy and response to selection over traditional pedigree based Best Linear Unbiased Prediction (PBLUP).
基因組選擇（GS）是一種利用全基因組標記和全同胞表型信息預(yù)測候選群體基因組EBV（GEBV）的方法，與傳統(tǒng)的基于系譜的最佳線性無偏預(yù)測（PBLUP）相比，該方法具有更高的準確性和選擇強度。
Widely used GS methods such as genomic BLUP (GBLUP), SNPBLUP, Bayes C and Bayesian Lasso may perform differently with respect to accuracy of GEBV prediction.
廣泛使用的GS方法如:GBLUP，SNPBLUP，貝葉斯C和Bayesian Lasso 在GEBV預(yù)測的準確性方面可能會有所不同。

作者提供了背景資料。（前三句）

怎么知道要提供什么樣的背景資料呢？
這類摘要開頭的背景信息通常來自引言的第一句話。（如例子中對應(yīng)的前言）

由細胞內(nèi)細菌鮭魚立克次氏體引起的鮭魚立克次體綜合癥（SRS）被認為是智利鮭魚養(yǎng)殖業(yè)的主要疾病之一

Our aim was to compare the accuracy, in terms of reliability of genome-enabled prediction, from different GS methods with PBLUP for resistance to SRS in an Atlantic salmon breeding program.
我們的目的是在大西洋鮭魚育種項目中，比較PBLUP和不同GS方法預(yù)測SRS的準確性。
Number of days to death (DAYS), binary survival status (STATUS) phenotypes, and 50 K SNP array genotypes were obtained from 2601 smolts challenged with P. salmonis.
從2601條經(jīng)過疾病浸染的二齡鮭中得到存活天數(shù)，生存狀態(tài)表型和50K SNP基因信息數(shù)據(jù)。
The reliability of different GS methods at different SNP densities with and without pedigree were compared to PBLUP using a five-fold cross validation scheme.
采用5折交叉驗證，比較了不同SNP密度下有無家系的不同GS方法與PBLUP的可信度。

第一句話作者將研究的總體目標概況出來
當我們在沒有副標題的情況，要試著縮短摘要的長度，可以把背景和目的結(jié)合起來，或者把本文所做的所發(fā)現(xiàn)的結(jié)合起來，減少字數(shù)，例如可以：In order to determine x we did y 把目的和方法結(jié)合在一起。
第二、三句話總結(jié)方法，并進一步提供了細節(jié)
我們要給出多少方法細節(jié)呢？
這取決于細節(jié)的重要性。如果我們研究的焦點就是方法，工作的主要貢獻就是在方法的細節(jié)上，可以而且應(yīng)該在摘要中提供這些細節(jié)。然而在很多情況下研究的重點并不是方法，所以應(yīng)該概括性闡述，把更多的細節(jié)留給結(jié)果。

結(jié)果

Heritability estimated from GS methods was significantly higher than PBLUP.
GS法估計的遺傳力顯著高于PBLUP法。
Pearson’s correlation between predicted GEBV from PBLUP and GS models ranged from 0.79 to 0.91 and 0.79–0.95 for DAYS and STATUS, respectively.
PBLUP和GS模型的預(yù)測GEBV在DAYS和STATUS的皮爾遜相關(guān)系數(shù)變化范圍分別為0.79-0.91和0.79-0.95。
The relative increase in reliability from different GS methods for DAYS and STATUS with 50 K SNP ranged from 8 to
25% and 27–30%, respectively.
對于50k SNP，不同GS方法的生存天數(shù)和生存狀態(tài)的可信度相對提高分別為8～25%和27～30%。
All GS methods outperformed PBLUP at all marker densities.
所有GS方法在所有標記密度下都優(yōu)于PBLUP。
DAYS and STATUS showed superior reliability over PBLUP even at the lowest marker density of 3 K and 500 SNP, respectively.
即使在最低標記密度3k和500SNP下，生存天數(shù)和存活狀態(tài)也顯示出比PBLUP更高的可靠性。
20 K SNP showed close to maximal reliability for both traits with little improvement using higher densities.
20 K SNP對兩個性狀均顯示出接近最大的可靠性，而使用更高的密度幾乎沒有改善。

先讓我們看一下正文結(jié)果部分的各個副標題
Estimated variance components with full data
Correlation between predicted breeding values
Reliability and bias of different models
Reliability of different models at varying marker density
可以明顯看出摘要中結(jié)果部分的闡述是按著正文部分排列的。
盡管摘要很短，但是它仍要完成論文一樣多的工作，意味著你必須要告訴讀者文章是否適合他們的需求。如果不寫數(shù)據(jù)分析情況，結(jié)果分析情況，將很難促使讀者對你的文章產(chǎn)生興趣。
我應(yīng)該給出多少結(jié)果細節(jié)？
結(jié)果可能是摘要中最重要的組成部分，您應(yīng)該具體說明并提供關(guān)鍵結(jié)果的詳細信息。避免使用模糊的字詞，例如較小或更好的詞。
如果您提供“naked numbers”，請嘗試使用定量語言。
避免使用模糊不清的敘述語言，講清在什么條件下，怎么做的。
給出準確的判斷結(jié)果，來證明作品的價值。

結(jié)論

These results indicate that genomic predictions can accelerate genetic progress for SRS resistance in Atlantic salmon and implementation of this approach will contribute to the control of SRS in Chile.
這些結(jié)果表明，基因組預(yù)測可以加速??大西洋鮭對SRS抗性的遺傳進展，并且該方法的實施將有助于智利對SRS的控制。
這里作者介紹了這項研究的意義。
摘要的另外一個重要功能是顯示研究的意義：如何促進該領(lǐng)域的知識和信息，這通常對應(yīng)著文章的目的或者研究的空白。
可以提及不同類型的含義，比如，根據(jù)您發(fā)現(xiàn)的相關(guān)問題或先前的研究產(chǎn)生的影響。
We recommend GBLUP for routine GS evaluation because this method is computationally faster and the results are very similar with other GS methods.
我們推薦使用GBLUP進行常規(guī)GS評估，因為該方法計算速度快，結(jié)果與其他GS方法非常相似。
此句對應(yīng)此前提出的關(guān)于不同GS方法預(yù)測SRS的準確性。
The use of lower density SNP or the combination of low density SNP and an imputation strategy may help to reduce genotyping costs without compromising gain in reliability.
使用低密度的SNP或者將低密度與imputation strategy結(jié)合可能有助于在保證遺傳進展的情況下降低基因分型成本。
對應(yīng)本文末尾需要進一步解決的工作

還有兩個需要關(guān)注的問題
有些語氣很柔和像“可能”這樣的詞語在這里合適嗎？
結(jié)果，含義和成就常常被非常肯定地陳述，來讓讀者閱讀本文的其余部分并接受結(jié)論。同時，對結(jié)果討論（包括可能的限制和約束）也可以留給文章本身。
但是，摘要中報告的內(nèi)容應(yīng)與論文中報告的內(nèi)容相一致，并且如果您的工作代表了突破的早期階段，或者您的工作含義仍未確定，則可以通過情態(tài)動詞（could/might/may）或諸如此類的詞來進行表達。

如果我的研究有問題，該如何處理——我需要在摘要中提到嗎？
如果真的這個問題很重要，你可以簡短的說出它們是什么，但是最好不要討論，摘要應(yīng)該 提供/總結(jié) 你發(fā)現(xiàn)的確切細節(jié)，重要的含義、數(shù)據(jù)和結(jié)果。很少的情況下包括出現(xiàn)的問題，除非它真的非常重要，還有未來的方向。

接下來我們對收集到的句子匯總
1.提供必需的背景
2.提出文章的主要目的
3.介紹使用的方法，并進一步提供細節(jié)
4.對結(jié)果進行展示
5.闡明研究的結(jié)果含義，研究意義，需要進一步研究的問題。

即可以分為下面五個板塊