最近看到了一個(gè)博客討論了細(xì)胞類型和細(xì)胞狀態(tài),詳見:https://mbernste.github.io/posts/cell_types_cell_states/,里面提到了Svennson 等人(2021)的預(yù)印本研究發(fā)現(xiàn),隨著研究人員測(cè)量更多的細(xì)胞,他們往往會(huì)發(fā)現(xiàn)更多的“細(xì)胞類型”。。。
為什么CD4和CD8的T細(xì)胞在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組水平本來就很難確定亞群和名字,因?yàn)榻^大部分已經(jīng)發(fā)表的文章對(duì)他們的細(xì)分都是依據(jù)細(xì)胞形態(tài),而不是真正的細(xì)胞類型。
比如:T細(xì)胞按照功能進(jìn)行劃分,naive, memory ,effector,cytotoxic,Exhaustion,其實(shí)他們都可以是CD4和CD8,其中CD4細(xì)胞因子產(chǎn)生情況和表面標(biāo)志物進(jìn)行分類有Th1,Th2,Th9,Th12,Th22, 可以說是非常復(fù)雜了。
另外,推薦兩個(gè)綜述,首先是2023年3月發(fā)表的,A reference cell tree will serve science better than a reference cell atlas,其次是2022年7月底發(fā)表的 What is a cell type and how to define it?