前言 胞葬作用（吞噬細胞清除程序性死亡的細胞）對控制腫瘤生長一定是有利的嗎？這可未必，最近剛發表在nature cancer上題為：Efferocytosis reprogr...
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弄巧成拙！清除損傷細胞的胞葬作用竟促進了胰腺導管癌肝轉移 -
新型血液指標能預測不同性別癌癥患者的免疫治療效果前言 抗 PD-1/PD-L1 和抗 CTLA-4 等免疫檢查點抑制劑(ICIs)的臨床應用極大的改變了實體瘤的治療策略，特別是提高了惡性黑色素瘤(MM)和非小細胞肺癌 (N...
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Cell解讀｜可編程的反應擴散系統用于揭示細胞的時空信號前言 細胞的生命活動受多種蛋白質的時空動態調控，這種動態組織和調控失衡會導致許多人類疾病，因此有必要認識細胞中蛋白質的時空組織和動態調控機理。目前，盡管一系列研究在這方面已經...
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文獻解讀｜孕激素通過Id2/Pim1通路減弱Th 17細胞在自身免疫性葡萄膜炎中的致病性前言 自身免疫性葡萄膜炎（autoimmune uveitis，AU）是眼科最常見的自身免疫性疾病（autoimmune disease，AD）之一，具有病因復雜、發病率高、...
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如何做到一套單細胞數據發兩篇高分SCI？說在前面 Immugent最近偶遇一個很好的乳腺癌單細胞數據--GSE161529，于是就想拿出來分享給大家。不僅是因為這個數據囊括的乳腺癌類型很全，而是作者利用這一套數據發...
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一文說清楚衰老T細胞的研究進展一、摘要 據世界衛生組織統計，目前全球大多數人的預期壽命均已達到60歲及以上；預計到2034年，老年人的數量將超過兒童；而到2050年，全球60歲及以上人口將達到21億人，其...
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OralExplorer：教你如何簡單制作自己的網頁工具前言 口腔炎癥(oral inflammatory disease)，指口腔軟組織和硬組織的感染，包括牙周炎、種植體周圍炎和齲齒。若不及時治療，可能會導致頜面部和系統部位的并...
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JCR1區！7.4分 單細胞聯合bulkRNAseq轉錄組+甲基化熱點+體內體外機制驗證，干濕結合典范!前言 今天給大家分享的文獻是2024年3月16日發表在“Journal of Translational Medicine”的一篇將干濕結合經典的文章，題目是《Single-...
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重大進展：Tfh細胞也有前體細胞啦前言 在生發中心（Germinal Center，GC）形成的過程中，濾泡輔助性T（T follicular helper，Tfh)細胞承擔著重要的角色。最初，科學家們基于其...
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tidyestimate：給免疫浸潤程度的評估提提速前言 還記得Immugent最開始做數據挖掘時，最常做的分析之一就是用ESTIMATE包來評估腫瘤組織的免疫浸潤情況，雖然得到的結果只有stromal score，immun...
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震驚！未成熟的NK細胞可以促進三陰性乳腺癌的進展前言 乳腺癌是女性最常見的腫瘤，是美國女性腫瘤相關死亡的第二大原因，據估計，2020年即有27.5萬多例新病例報告。三陰性乳腺癌（Triple-negative breast...
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babelgene：滿足你對基因互轉的所有想象
前言在日常分析中，我們經常會遇到對同一物種基因ID和symbol之間的互轉，或者是不同物種之間同源基因的互轉。雖然目前已經有幾個包，比如：biomaRt，easyConver...
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當單細胞遇上LncRNA：實現非polyA轉錄本的捕獲LncRNA的概念及功能 LncRNA的概念 長鏈非編碼RNA（long non-coding RNA, LncRNA）是一類長度大于200nt但不編碼蛋白質的非編碼RNA，...
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當單細胞遇上circRNA：揭示其細胞功能調控的利器circRNA的概念及功能 circRNA的概念 環形RNA分子（Circular?RNAs，circRNAs）是一類特殊的非編碼RNA分子，主要是通過反向剪接機制產生，表現...
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生信數據挖掘+實驗驗證 | 鑒定RECK基因為胃癌的保護性預后指標和腫瘤抑制因子（抑制ERK/MAPK 信號通路）前言 據相關統計，胃癌 (GC) 在所有癌癥中的發生率位居第五位，相關死亡率排第四位。大多數GC患者在診斷時已處于晚期并發生腫瘤轉移，導致預后不佳，5年總生存率低于30%。因...
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當單細胞遇上巨噬細胞：腫瘤免疫治療的新希望巨噬細胞簡介 1. 巨噬細胞的基本特征 巨噬細胞（Macrophages）是由骨髓造血干細胞衍生出的一種重要的免疫細胞，其是單核吞噬細胞系（Mononuclear Phago...
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EcoTyper代碼實操（六）：在預先分選細胞類型的數據中發現細胞狀態和生態型前言 EcoTyper是一個基于機器學習的工具，能夠從Bulk、單細胞、以及空間分辨率的基因表達數據中大規模地識別并驗證細胞狀態和生態型。我們在前面的推文中介紹了EcoTyp...
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EcoTyper代碼實操（五）：在scRNA-seq數據中發現細胞狀態和生態型前言 EcoTyper是一個基于機器學習的工具，能夠從Bulk、單細胞、以及空間分辨率的基因表達數據中大規模地識別并驗證細胞狀態和生態型。我們在前面的推文中介紹了EcoTyp...
