干貨錦囊|質譜流式抗體選擇小妙招

質譜流式細胞術通常被認為是基于熒光流式細胞術的改良技術,其用不同重金屬穩(wěn)定同位素(圖1)代替熒光基團來標記不同抗體。然后將單個細胞霧化電離,僅保留與相應抗體一一對應的金屬離子信息。最后用TOF探測器對單個細胞的離子云進行分析,還原其細胞marker信息。

圖1 質譜流式(CyTOF)——你熟悉的流式細胞術Plus

您是否對質譜流式抗體選擇感到困惑?

在科研領域中,抗體的選擇至關重要,尤其是在流式細胞術/質譜流式技術中。質譜流式技術結合了質譜和流式細胞術的優(yōu)勢,為我們提供了在細胞層面深入研究細胞蛋白質組的能力。然而,正確選擇適用的抗體對于實驗結果的準確性至關重要。

在本文中,我們將分享一些關于質譜流式抗體選擇的小妙招,幫助您在研究中取得更可靠、更精確的數(shù)據(jù)。

1. BSA free

一般情況下,溶解抗體的PBS 緩沖液通常含有牛血清白蛋白(BSA)、甘油、疊氮化鈉。其中蛋白質穩(wěn)定劑BSA能防止抗體降解,減少非特異性結合。但BSA會干擾利用金屬穩(wěn)定同位素標簽(圖 2)標記抗體時所用還原劑的效果,且BSA可能與目標抗競爭性結合金屬穩(wěn)定同位素標簽,以至大幅度降低金屬穩(wěn)定同位素與抗體的偶聯(lián)效率。并且干擾后續(xù)標記效率檢測的電泳結果。

圖2 質譜流式(CyTOF)廣泛應用金屬穩(wěn)定同位素標簽

2. 單克隆抗體(monoclonal antibodies, mAb)

存在于抗原表面的,決定抗原特異性的特殊化學基團稱為抗原決定簇,又稱抗原表位。一個抗原可以有一種或多種不同的抗原表位,每種表位只有一種抗原特異性。

多克隆抗體(polyclonal antibody, pAb):由多種抗原決定簇刺激機體,相應地就產(chǎn)生各種各樣的單克隆抗體,這些單克隆抗體混雜在一起就是多克隆抗體,機體內所產(chǎn)生的抗體就是多克隆抗體。

單克隆抗體:由一種抗原決定簇刺激機體,由一個B淋巴細胞接受該抗原刺激所產(chǎn)生的抗體稱之為單克隆抗體。

質譜流式應選擇單克隆抗體進行試驗,其特異性地檢測單個表位,不易與其它蛋白質發(fā)生交叉反應??梢愿咝ЫY合抗原,提升實驗結果的一致性和標準化水平。

3. 抗體類型——IgG

用于質譜流式的抗體應具有以下特征:

易獲取,較穩(wěn)定:根據(jù)重鏈可將免疫球蛋白G(Immunoglobulin G,IgG)分為IgM、IgD、IgG、IgA和IgE五類。其中,IgG的分子量小且半衰期長,分解比較慢,所以是血清中含量最多的免疫球蛋白(占Ig量的75%)。

易于設置同型對照:質譜流式、流式細胞實驗有必要選擇與待測抗體Panel同種屬來源,同亞型,同金屬同位素標記的抗體用于消除由于抗體非特異性結合到細胞表面而產(chǎn)生的背景染色,相當于實驗的陰性對照。

4. 非同種屬來源抗體

為了降低非特異性結合,應用于質譜流式的抗體應選取與反應物種非同物種來源的抗體。例如,檢測人相關蛋白時應選取非人(鼠源,兔源,羊源等)物種來源的抗體。

5. 抗體規(guī)格——100 μg

此規(guī)格為金屬同位素標記抗體的標記效率和回收得率良好的一般抗體規(guī)格。

6. 應用

質譜流式的抗體應優(yōu)先選用已經(jīng)在流式細胞術得到驗證的抗體。

7. 標記

質譜流式的抗體應選擇沒有任何標記的裸抗。

質譜流式(Mass Cytometry)細胞儀是跨時代的高通量流式細胞儀,可在單次實驗中獲得40余種蛋白的表達信息。不僅僅是細胞表面Marker,還可以獲得胞內蛋白,例如蛋白磷酸化通路和代謝相關的信息。質譜流式利用飛行時間質譜(TOF)作為檢測手段,具有檢出限低、動態(tài)線性范圍廣(ng/L~mg/L)、干擾少、分析精密度高等優(yōu)點,可以同時測定多種元素,并且同一樣品不同時間檢測結果間的變異系數(shù)值小于3%。質譜流式細胞技術可以在單細胞層面對樣本進行更多的參數(shù)檢測,使細胞的研究更具深度和廣度,是流式細胞技術一個新的發(fā)展方向。它能夠實現(xiàn)更為精確全面的免疫分型及細胞內信號網(wǎng)絡分析,在外部感染、自身免疫、腫瘤研究等領域有著廣泛的應用前景。

參考文獻:

Guojun Han, Matthew H. Spitzer, Sean C. Metal-isotope-tagged monoclonal antibodies for high-dimensional mass cytometry [J]. Nature protocols 13, 2121–2148 (2018).

?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個濱河市,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 227,663評論 6 531
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場離奇詭異,居然都是意外死亡,警方通過查閱死者的電腦和手機,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 98,125評論 3 414
  • 文/潘曉璐 我一進店門,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來,“玉大人,你說我怎么就攤上這事?!?“怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 175,506評論 0 373
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長。 經(jīng)常有香客問我,道長,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 62,614評論 1 307
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮,結果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己,他們只是感情好,可當我...
    茶點故事閱讀 71,402評論 6 404
  • 文/花漫 我一把揭開白布。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開封第一講書人閱讀 54,934評論 1 321
  • 那天,我揣著相機與錄音,去河邊找鬼。 笑死,一個胖子當著我的面吹牛,可吹牛的內容都是我干的。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 43,021評論 3 440
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼!你這毒婦竟也來了?” 一聲冷哼從身側響起,我...
    開封第一講書人閱讀 42,168評論 0 287
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎,沒想到半個月后,有當?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 48,690評論 1 333
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 40,596評論 3 354
  • 正文 我和宋清朗相戀三年,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點故事閱讀 42,784評論 1 369
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖,靈堂內的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 38,288評論 5 357
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站,受9級特大地震影響,放射性物質發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 44,027評論 3 347
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧,春花似錦、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 34,404評論 0 25
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 35,662評論 1 280
  • 我被黑心中介騙來泰國打工, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 51,398評論 3 390
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長得像,于是被迫代替她去往敵國和親。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 47,743評論 2 370

推薦閱讀更多精彩內容