Nature Medicine | 個(gè)體化、異源的黑猩猩腺病毒和自擴(kuò)增的mRNA新抗原疫苗治療晚期轉(zhuǎn)移性實(shí)體腫瘤

文獻(xiàn)鏈接:Individualized, heterologous chimpanzee adenovirus and self-amplifying mRNA neoantigen vaccine for advanced metastatic solid tumors: phase 1 trial interim results
發(fā)表期刊:Nature Medicine
影響因子:87
發(fā)表時(shí)間:2022年8月
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序用于臨床I/II期--藥效評(píng)估與安全性機(jī)制研究
該臨床試驗(yàn)已經(jīng)推進(jìn)到II/III期,招募非小細(xì)胞肺癌,結(jié)直腸癌,胃食管腺癌,尿路上皮癌:A Study of a Personalized Neoantigen Cancer Vaccine-NCT03639714

0. 研究背景

先前的研究結(jié)果表明,一種成功的癌癥疫苗應(yīng)有以下5個(gè)特征:(1)靶向腫瘤特異性新抗原,(2)使用高免疫原性疫苗平臺(tái)(s),(3)足以刺激機(jī)體擴(kuò)增和啟動(dòng)T細(xì)胞反應(yīng),(4)與CPI治療結(jié)合,(5)產(chǎn)生長(zhǎng)期記憶反應(yīng)。

在這項(xiàng)最新研究中,研究團(tuán)隊(duì)以個(gè)性化、異源黑猩猩腺病毒(ChAd68)委內(nèi)瑞拉馬腦炎病毒samRNA載體為基礎(chǔ)的新抗原疫苗作為主要研究端點(diǎn),評(píng)估其安全性和耐受性等指標(biāo)。

1. 臨床前實(shí)驗(yàn)

在NHPs中評(píng)估了針對(duì)猴免疫缺陷病毒(SIV)模型抗原的免疫應(yīng)答的效力和作用時(shí)間,以及皮下注射抗CTLA-4的影響
理解備注:恒河猴的組織相容性復(fù)合體命名為MAMU(就如同人類的被稱為HLA);NHP特異性MAMU-A*01限制性SIV抗原插入到ChAd68和samRNA疫苗平臺(tái)

1.1 疫苗接種誘導(dǎo)NHPs中持久的CD8+ T細(xì)胞應(yīng)答

實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì):

  • (1)疫苗接種方案:對(duì)MAMU-A*01陽(yáng)性的恒河猴(n=11)進(jìn)行肌肉注射ChAd68疫苗首次激發(fā)免疫,接下來(lái)的第4、12和20周時(shí)通過(guò)肌肉注射samRNA疫苗增強(qiáng)免疫,第32周再給予ChAd68增強(qiáng)型疫苗,第106周(n=11)再給予samRNA增強(qiáng)型疫苗(圖1)
  • (2)CPI治療方案:以上參與疫苗接種方案的恒河猴中(n=11),其中部分實(shí)驗(yàn)動(dòng)物(n=6)伴隨使用伊匹單抗(CTLA-4單抗),部分(n=5)未接受CPI治療
圖1. 研究治療計(jì)劃示意圖
  • ChAd68疫苗誘導(dǎo)了對(duì)所有六種抗原的免疫反應(yīng):在給予samRNA后,啟動(dòng)的T細(xì)胞反應(yīng)增強(qiáng),兩組患者在啟動(dòng)32周后仍可檢測(cè)到T細(xì)胞反應(yīng);同時(shí)給予注射伊匹單抗可維持整體較高的T細(xì)胞反應(yīng)(圖2b)
  • 增強(qiáng)型ChAd68疫苗能顯著刺激免疫反應(yīng):第32周再給予ChAd68使T細(xì)胞反應(yīng)分別增加12-15倍(圖2c)
  • 增強(qiáng)型samRNA疫苗能顯著刺激免疫反應(yīng):第106周再給予samRNA疫苗,在第107周檢測(cè)到的抗原特異性T細(xì)胞反應(yīng)增加8-17倍(圖2d)
    圖2. 用ChAd68和samRNA進(jìn)行異源疫苗接種可誘導(dǎo)NHPs中廣泛、持久的CD8+ T細(xì)胞反應(yīng),這些反應(yīng)可長(zhǎng)期檢測(cè)到(注射2年后仍然顯著提高);圖b. 抗原特異性T細(xì)胞反應(yīng)評(píng)估:研究不同組在不同時(shí)間點(diǎn)的T細(xì)胞反應(yīng);圖c.ChAd68增強(qiáng)前后(32th周和33th周)抗原特異性T細(xì)胞反應(yīng):每只動(dòng)物對(duì)所有抗原的平均反應(yīng);圖d. samRNA增強(qiáng)前后(106th周和107th周)抗原特異性T細(xì)胞反應(yīng):每只動(dòng)物對(duì)所有抗原的平均反應(yīng)

2. 臨床實(shí)驗(yàn)

針對(duì)個(gè)體化預(yù)測(cè)的腫瘤疫苗的免疫反應(yīng)以及疫苗引起的T細(xì)胞多樣性分析在臨床I/II期實(shí)驗(yàn)進(jìn)行
研究對(duì)象:轉(zhuǎn)移型MSS晚期結(jié)直腸癌;非小細(xì)胞肺癌;胃食管腺癌
研究第1期的主要終點(diǎn)是安全性、耐受性和RP2D。
次要和探索性終點(diǎn)包括免疫原性、OS、制造患者特異性疫苗的可行性和ctDNA的變化。
所有患者中(包括疫苗接種前缺乏免疫反應(yīng)的MSS-CRC患者)均觀察到腫瘤新生抗原誘導(dǎo)的特異性CD8+ T細(xì)胞。同時(shí),ctDNA減少,疾病穩(wěn)定,腫瘤體積縮小的特征都表明該手段在CPI難治型患者中存在潛在的臨床有效性。

在腫瘤I期臨床試驗(yàn)中,主要目的是為了找到 II期推薦劑量(RP2D) 或者 MTD(最大耐受劑量);總生存(overall survival,OS),定義為:從隨機(jī)化開始至(因任何原因)死亡的時(shí)間。

1. 方案設(shè)計(jì):(參考圖4a)

入組患者:符合條件的患者共計(jì)14位:中位年齡為59歲;腫瘤類型包括轉(zhuǎn)移性MSS-CRC(n=7)、GEA(n=6)或NSCLC(n=1)
疫苗生產(chǎn):對(duì)于每個(gè)累計(jì)預(yù)測(cè)新抗原評(píng)分達(dá)到30的患者,篩選20個(gè)排名最高的突變納入密碼子優(yōu)化的疫苗表達(dá)盒中。為15名登記的患者生產(chǎn)了患者特異性疫苗(證實(shí)這種個(gè)體化疫苗接種方法的生產(chǎn)可行性),后續(xù)有1位患者放棄接受研究治療。
疫苗注射:ChAd68疫苗注射單針后,后續(xù)多次靜脈注射samRNA疫苗,疫苗劑量分3個(gè)梯度(30ug, 100ug, 300ug)
CPI治療方案:14例患者接受疫苗接種和每月的靜脈注射PD-1抗體(尼魯單抗,每4周480mg),另外,dose level 3和dose level 4的患者也同時(shí)接種伊匹單抗(30mg)
其他:4例患者(G1、G8、G9和G10)繼續(xù)接受了研究治療的標(biāo)準(zhǔn)護(hù)理化療,8例患者在初次接種疫苗24周后接受了單一的加強(qiáng)型ChAd68疫苗

2. 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì):(參考圖3)

圖3. 概述個(gè)性化疫苗生產(chǎn)、計(jì)劃給藥計(jì)劃和免疫監(jiān)測(cè)的示意圖

2.1 個(gè)體化疫苗方案安全、耐受性良好
  • 個(gè)性化疫苗治療相關(guān)副反應(yīng)低:發(fā)熱(86%)、疲勞(43%)、肌肉骨骼和注射部位疼痛(均為36%)和腹瀉(29%);嚴(yán)重的TRAEs與已知的CPI治療的安全性基本一致,包括發(fā)熱、十二指腸炎、轉(zhuǎn)氨酶增加和甲狀腺功能亢進(jìn)各一個(gè)計(jì)數(shù)(圖4b)
圖4. 首次在人體中的數(shù)據(jù)顯示,該疫苗方案是安全的,并誘導(dǎo)CD8+ T細(xì)胞對(duì)預(yù)測(cè)的患者特異性癌癥新抗原反應(yīng);圖a.臨床I期研究的劑量遞增示意圖;圖b. 安全性數(shù)據(jù):TRAEs>10%和所有治療相關(guān)的嚴(yán)重不良事件(AEs):藍(lán)色bar表示1-2級(jí),橙色bar表示3-4級(jí);圖c左. 治療前患者PBMC中的抗原特異性T細(xì)胞反應(yīng)評(píng)估:都在基線水平;圖c中:ChAd啟動(dòng)和samRNA增強(qiáng)后抗原特異性T細(xì)胞的最大反應(yīng);圖c右. ChAd增強(qiáng)后的最大反應(yīng);虛線表示檢測(cè)限(LOD)和定量上限(ULOQ)
2.2 疫苗誘導(dǎo)新抗原特異性免疫應(yīng)答長(zhǎng)效持久

設(shè)計(jì)了個(gè)體患者最小表位(8-11mer)肽池(包括40個(gè)排名最高的預(yù)測(cè)新表位),標(biāo)記為 CD8 pool,用于取患者PBMC通過(guò)與對(duì)應(yīng)肽池孵育刺激IFN-γ反應(yīng),然后體外ELISpot檢測(cè)IFN-γ反應(yīng)強(qiáng)度

  • ChAd68疫苗顯著誘導(dǎo)新抗原特異性CD8+ T細(xì)胞:接種疫苗前,只有15%的患者對(duì)新生抗原肽池的反應(yīng)超過(guò)LOD值;疫苗接種后均顯著提升(圖4c)
  • ChAd68疫苗誘導(dǎo)的T細(xì)胞應(yīng)答長(zhǎng)效持久:在3例現(xiàn)有縱向樣本中,第52周仍然檢測(cè)到抗原特異性T細(xì)胞的高效應(yīng)答(圖5 A,B)
  • 更低的劑量和更長(zhǎng)的間隔可能有助于samRNA平臺(tái)驅(qū)動(dòng)T細(xì)胞反應(yīng):患者G1(GEA,伴隨化療)中,T細(xì)胞在samRNA增強(qiáng)疫苗注射的8周間隔內(nèi)擴(kuò)大了1.5倍,并在第52周給予samRNA疫苗后的16周內(nèi)持續(xù)保持>700 SFU/10^6細(xì)胞;G3患者(NSCLC)中,觀察到在第24周和第36周時(shí),samRNA劑量之間的CD8+ T細(xì)胞反應(yīng)增加了7倍;患者G2(GEA)T細(xì)胞反應(yīng)在第4周至第13周的(9周)samRNA給藥間隔期間顯示~1.5倍的T細(xì)胞反應(yīng)增加(圖5A,C)

2019年新冠病毒限制期間,samRNA給藥間隔延長(zhǎng)了8-16周,揭示了samRNA增強(qiáng)T細(xì)胞反應(yīng)動(dòng)力學(xué)的有趣見(jiàn)解

圖5. 疫苗誘導(dǎo)新抗原特異性免疫應(yīng)答長(zhǎng)效持久;圖A. 所有可用樣本(除G5外)在不同階段取樣,體外特異性肽池過(guò)夜刺激后的IFNγ ELISpot數(shù)據(jù);圖B. G1,G2,G8在不同階段取樣,體外特異性肽池過(guò)夜刺激后的IFNγ ELISpot數(shù)據(jù);圖C. 疫苗注射前后ELISpot反應(yīng)差異:折線圖顯示了接受30μg samRNA(淺藍(lán)色)、100μg samRNA(中藍(lán)色)和300μg samRNA(海軍藍(lán))的患者的配對(duì)數(shù)據(jù)
2.3 CD8+ T細(xì)胞可以識(shí)別多個(gè)HLA等位基因中的新抗原

因?yàn)?CD8 pool 這種探索最小表位池設(shè)計(jì)不包括每種突變對(duì)應(yīng)的所有潛在新抗原(即,太短了),并且不成比例地支持較高預(yù)測(cè)分?jǐn)?shù)的突變抗原形式,因而作者額外設(shè)計(jì)了稱為 15 mer pool的表位池

  • 較長(zhǎng)的抗原肽誘導(dǎo)抗原特異性T細(xì)胞免疫反應(yīng)需要混合CD4 T細(xì)胞參與:在5例有可用樣本(G1、G2、G8、G8、G11和G14)的患者中,分析了對(duì)同源CD8 pool和15mer pool的CD8和CD4 T細(xì)胞偏倚的反應(yīng)。根據(jù)肽長(zhǎng)度的預(yù)期,CD8 pool刺激后的IFN-γ反應(yīng)是由CD8 T細(xì)胞驅(qū)動(dòng)的,而對(duì)15mer pool刺激的反應(yīng)是CD8驅(qū)動(dòng)或混合CD4/CD8 T細(xì)胞反應(yīng)(圖6)
圖6.流式圖顯示CD4或CD8缺失(del)PBMC群體中CD8和CD4 T細(xì)胞的相對(duì)頻率。相應(yīng)的ELISpot數(shù)據(jù)(技術(shù)重復(fù)±s.d.的平均SFU)用二甲基亞砜(DMSO)、total PBMCs(黑色bar+灰色圈)、CD4缺失PBMC(藍(lán)色bar+黑方塊)、CD8缺失PBMCs(橙色bar+紅三角)分別與CD8 pool與15 mer pool 孵育
  • 個(gè)性化疫苗能夠激活多種抗原特異性T細(xì)胞:所有12例患者在治療后的時(shí)間點(diǎn)均可檢測(cè)到T細(xì)胞對(duì)多個(gè)突變的反應(yīng)(圖7a)
  • CD8+ T細(xì)胞可以識(shí)別多個(gè)HLA等位基因中的新抗原:G1,G2,G8患者的混合白細(xì)胞pool對(duì)3位患者個(gè)性化疫苗中>50%的多個(gè)HLA等位基因中的新抗原產(chǎn)生陽(yáng)性反應(yīng)(圖7b,c)

Peptide-HLA (pHLA)四聚體被生成,用于評(píng)估抗原特異性T細(xì)胞的廣度和記憶表型。基于G1,G2,G8的HLA設(shè)計(jì)pHLA與對(duì)應(yīng)的T細(xì)胞孵育

  • 個(gè)性化疫苗誘導(dǎo)的特異性T細(xì)胞具有較強(qiáng)的記憶特性:與總CD8 T細(xì)胞相比,四聚體陽(yáng)性CD8 T細(xì)胞的效應(yīng)記憶特征高1.3-1.5倍,幼稚T細(xì)胞的頻率低20倍(圖7d)
  • ChAd68 boost疫苗顯著提高患者抗原特異性效應(yīng)記憶細(xì)胞比例:患者G1的ChAd68 boost導(dǎo)致四聚體陽(yáng)性細(xì)胞增加10倍,增強(qiáng)后四聚體陽(yáng)性CD8 T細(xì)胞由≥93%的效應(yīng)記憶細(xì)胞組成(圖7e)。
圖7. 疫苗誘導(dǎo)多種新抗原的多克隆效應(yīng)記憶CD8 T細(xì)胞應(yīng)答;圖a. 患者PBMC體外和post-IVS在抗原特異性minipool刺激:橫坐標(biāo)表示不同患者,縱坐標(biāo)表示反應(yīng)比例,不同的顏色表示不同的minpool;圖b. 最小陽(yáng)性表位檢出量:檢出多肽陽(yáng)性的數(shù)量:無(wú)法檢出陽(yáng)性反應(yīng)的用'x'表示;
圖7. 疫苗誘導(dǎo)多種新抗原的多克隆效應(yīng)記憶CD8 T細(xì)胞應(yīng)答;圖c. 預(yù)測(cè)的患者特異性HLA I型遞呈抗原陽(yáng)性(panel b);圖d. G2患者中pHLA(A*30:04、A*02:01、B*08:01)的識(shí)別和相應(yīng)的T細(xì)胞記憶表型;
圖7. 疫苗誘導(dǎo)多種新抗原的多克隆效應(yīng)記憶CD8 T細(xì)胞應(yīng)答;圖e. G2患者在ChAd68增強(qiáng)前后對(duì)pHLA(B*44:05)的識(shí)別情況和相應(yīng)的T細(xì)胞記憶表型
2.4 疫苗誘導(dǎo)CD8+ T細(xì)胞是多功能的,可以殺死靶細(xì)胞

評(píng)估該疫苗方案可以誘導(dǎo)細(xì)胞毒性T細(xì)胞,殺死在MHCI類環(huán)境中呈現(xiàn)同源表位的靶細(xì)胞
細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞因子染色 (ICS) 是一種非常有用且廣泛使用的基于流式細(xì)胞術(shù)的檢測(cè)方法,可檢測(cè)細(xì)胞刺激后內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)細(xì)胞因子的產(chǎn)生和積累。染色原理: 使用特定肽或非特異性激活混合物激活細(xì)胞---->添加蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)抑制劑(例如布雷非菌素 A)以將細(xì)胞因子保留在細(xì)胞內(nèi)---->洗滌后,可以將針對(duì)其他細(xì)胞標(biāo)志物的抗體添加到細(xì)胞懸液中---->然后將細(xì)胞固定在多聚甲醛中并透化---->加入抗細(xì)胞因子抗體---->細(xì)胞可通過(guò)流式細(xì)胞儀分析

  • 抗原特異性CD8+ T細(xì)胞是多功能的:通過(guò)IVS體外培養(yǎng)將G2和G8的PBMCs與CD8 pool孵育擴(kuò)增,檢測(cè)到IFN-γ+,CD107α+,腫瘤壞死因子α(TNF-α)+和白細(xì)胞介素-2(IL-2)+CD8T細(xì)胞,增加2~700倍(圖8a);布爾門控證實(shí)了兩名患者均存在四、三、雙陽(yáng)性多功能CD8 T細(xì)胞(圖8b)
  • 抗原特異性CD8 T細(xì)胞能夠殺死呈遞新抗原的靶細(xì)胞:將G2患者的抗原特異性T細(xì)胞與同型抗原肽表達(dá)的靶細(xì)胞共孵育,能夠顯著降低靶細(xì)胞活性(圖8c)
    圖8. 腫瘤新抗原反應(yīng)性CD8 T細(xì)胞具有功能多樣性,能夠殺死HLA呈現(xiàn)目標(biāo)同源肽的腫瘤細(xì)胞;圖a. G2患者經(jīng)DMSO或患者特異性CD8 pool刺激后產(chǎn)生IFN-γ、CD107α、TNF-α和IL-2流式分析圖;圖b. 通過(guò)CD8+細(xì)胞因子+群體的布爾門控評(píng)估多功能性:餅狀圖顯示了體外pbmc和IVS后pbmc的多功能性,餅弧用紅色(CD107α)、石灰綠色(IFN-γ)、綠松石色(TNF-α)和海軍藍(lán)(IL-2)表示單個(gè)細(xì)胞因子,餅類部分描述了表達(dá)多種細(xì)胞因子的細(xì)胞的頻率(詳細(xì)參考下方圖例,不同顏色表示不同陽(yáng)性類別),主要功能劃分為紅色(CD107α、IFN-γ、TNF-α和IL-2呈四倍陽(yáng)性)、橙色(CD107α、IFN-γ和TNF-α呈三倍陽(yáng)性)和黃色(CD107α和IFN-γ呈雙陽(yáng)性)
2.5 疫苗誘導(dǎo)的T細(xì)胞實(shí)現(xiàn)腫瘤浸潤(rùn)

實(shí)驗(yàn)分組:患者治療前和治療后
樣本類型:腫瘤穿刺組織和PBMC
實(shí)驗(yàn)類型: 腫瘤穿刺組織(基因組測(cè)序);PBMC樣本(scRNA-seq & TCR-seq)

圖9. 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)概覽

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)論:

  • 與基線水平相比,治療后樣本中的新抗原反應(yīng)性CD8+ T細(xì)胞增加了1.6倍至6.4倍(圖10 b)

  • 對(duì)轉(zhuǎn)錄激活特征的分析證實(shí)了CD8+ T細(xì)胞在處理后的樣本中顯著富集(圖10 c)

  • TCR分析顯示,在G1和G3患者接種疫苗后,PBMCs中分別檢測(cè)到12種和30種不同的 TCR克隆型(de novo + expanded)(圖10 b)。

  • 通過(guò)對(duì)T細(xì)胞各克隆型中IFNG、GZMB、TNFA和IL2轉(zhuǎn)錄本的分析顯示,與基線水平相比,兩名患者在治療后的樣本中表達(dá)兩種或兩種以上細(xì)胞因子轉(zhuǎn)錄本的頻率增加了12-98倍(圖10 d,e)


    圖10. 單細(xì)胞測(cè)序結(jié)論;圖B. Post-IVS ELISpot分析:基線(W0、橙色),治療(W16;藍(lán)色)時(shí)間點(diǎn)對(duì)應(yīng)于G1和G3患者治療時(shí)的腫瘤活檢樣本(W16),TCR克隆型分析來(lái)源于PBMC scRNA-seq;圖C. 小提琴圖顯示了G1和G3患者的基線(橙色)和治療時(shí)(藍(lán)色)PBMC樣本中CD3、CD4和CD8 mRNA表達(dá)的分析;圖D. UMAP圖顯示了處理樣本中表達(dá)TCR克隆型的單個(gè)細(xì)胞(封閉的圓圈,G1=12,G3=27),并表達(dá)0、1、2、3或4個(gè)細(xì)胞因子轉(zhuǎn)錄本;圖E. UMAP圖顯示個(gè)體細(xì)胞表達(dá)≤1(藍(lán)色)和≥2細(xì)胞因子(紅色)和感興趣的TCR克隆型(G1為=12,G3為=27),比較基線和處理樣本

來(lái)自G1和G3患者的基線和治療時(shí)的腫瘤活檢樣本通過(guò)批量DNA測(cè)序分析TCR-β CDR3序列的存在。通過(guò)PBMCs中的單細(xì)胞RNA測(cè)序獨(dú)立獲得的TCR-β CDR3序列與腫瘤樣本中的DNA測(cè)序的分析表明,血液和腫瘤中假定的新抗原特異性T細(xì)胞存在重疊。

  • 對(duì)于患者G1,在基線和治療時(shí)的腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)了341個(gè)TCR-β CDR3克隆型,其中治療期顯著富集了9個(gè)克隆,其中的2種也在治療時(shí)活檢時(shí)取樣的PBMCs中被發(fā)現(xiàn)(圖11d)
  • 在患者G3中,通過(guò)基線和治療時(shí)的腫瘤樣本DNA測(cè)序共鑒定出294個(gè)TCR-β CDR3克隆型,其中40個(gè)克隆型在治療時(shí)的樣本中顯著富集。在治療時(shí)活檢中富集的40個(gè)TCR-β CDR3克隆型中的5個(gè)與在治療時(shí)活檢時(shí)在PBMCs中激活的TCR克隆型重疊(圖11d)

結(jié)論:腫瘤組織中新抗原特異性CD8 T細(xì)胞的克隆型,提供了疫苗誘導(dǎo)的周圍新抗原特異性T細(xì)胞能夠浸潤(rùn)腫瘤的概念證明

圖11. 疫苗誘導(dǎo)的T細(xì)胞實(shí)現(xiàn)腫瘤浸潤(rùn);圖c. IVS擴(kuò)增G2患者的PBMCs殺死靶細(xì)胞(B*08:01,B*57:01,A*30:04):圖顯示了基于NucRed計(jì)數(shù)的相對(duì)可行性,并隨時(shí)間歸一化為效應(yīng)靶比10:1 DMSO控制。數(shù)據(jù)以平均± s.d表示。對(duì)于單獨(dú)用DMSO(灰色圓圈)或同源肽(黑色方塊)刺激的重復(fù)孔,以及用DMSO(淺藍(lán)色圓圈)或同源肽(海軍藍(lán)色方塊)刺激的10:1效應(yīng)/目標(biāo)共培養(yǎng);圖d. G1和G3患者TCR β鏈測(cè)序:TCR-β鏈在PBMCs中擴(kuò)張,在PBMCs和腫瘤中擴(kuò)張,并收縮

2.6 MSS-CRC患者存活時(shí)間延長(zhǎng),ctDNA含量降低

評(píng)估指標(biāo):OS和通過(guò)成像評(píng)估的腫瘤大小的變化(RECIST v1.1,次要終點(diǎn)),轉(zhuǎn)錄譜和ctDNA的變化(探索終點(diǎn))。
根據(jù)RECIST v1.1(實(shí)體瘤療效評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)),客觀緩解率和無(wú)進(jìn)展生存期顯示一個(gè)GEA患者有完全緩解,以及多個(gè)腫瘤類型的患者病情穩(wěn)定(SD)??紤]到在幾例MSS-CRC患者中觀察到的SD,作者重點(diǎn)分析了這7例MSS-CRC患者的OS次要終點(diǎn)和ctDNA較基線變化的探索性終點(diǎn)。對(duì)于MSS-CRC患者,7例患者中有3例(42.9%)仍然存活,12個(gè)月的OS率為42.9%,反映了多個(gè)患者經(jīng)歷了持久的獲益。新的證據(jù)表明,治療時(shí)ctDNA水平相對(duì)于基線的變化是一個(gè)有用的生物標(biāo)志物,可以將患者分為有分子應(yīng)答者或無(wú)分子應(yīng)答者,并區(qū)分預(yù)后良好的患者,特別是那些根據(jù)RECIST v1.1標(biāo)準(zhǔn)有SD的患者。

  • 本研究隊(duì)列皆為CPI難治性的冷腫瘤: 在患者治療前的腫瘤活檢樣本中,分析了對(duì)CPIs敏感性腫瘤的標(biāo)準(zhǔn)基因組相關(guān)性(即腫瘤突變負(fù)擔(dān)、CD274(PD-L1)和IFNG RNA測(cè)序特征),并與癌癥基因組圖譜(TCGA)中的相關(guān)癌癥類型進(jìn)行了比較。預(yù)處理患者基因組數(shù)據(jù)顯示,本研究中MSS-CRC和GEA患者的腫瘤突變負(fù)荷較低,PD-L1表達(dá)較低,且這些腫瘤的免疫反應(yīng)性較低(圖12 a,b)。這種冷性腫瘤已知對(duì)CPI治療是難治性的。

  • 長(zhǎng)期接受疫苗治療患者ctDNA明顯降低: 在這些患者中,100%(3/3)治療時(shí)間<6個(gè)月的ctDNA濃度增加,而療程≥6個(gè)月的75%(3/4)患者表現(xiàn)出分子反應(yīng)(<較基線水平50%;圖12c)。2例患者在治療期間ctDNA完全清除(G8和G14;圖12c)。最值得注意的是,這些ctDNA的這些下降在OS延長(zhǎng)的患者中更為常見(jiàn)(中位OS未達(dá)到,而不是7.8個(gè)月;圖12d)。

    圖12. 在晚期癌癥患者群中,MSS-CRC患者出現(xiàn)臨床療效的早期信號(hào);圖a. 治療前患者的腫瘤樣本RNA-seq數(shù)據(jù)散點(diǎn)圖:橫軸表示對(duì)應(yīng)癌種在TCGA的相對(duì)腫瘤突變負(fù)荷,縱坐標(biāo)表示PD-L1歸一化的表達(dá)量;圖b. IFN-γ信號(hào)強(qiáng)度比較:TCGA樣本- MSS-CRC(n= 286)、MSI-CRC(n= 62)、胃(n= 406)、肺腺癌(肺Ad.)_(n= 498),肺鱗狀(肺平方平方)(n= 463)和黑色素瘤(n= 436),臨床研究患者-MSS-CRC(n= 7),GEA(n= 6)和NSCLC(n= 1);圖c. 研究治療開始后ctDNA相對(duì)于基線水平的變化百分比,顯示為最佳反應(yīng),并由基于RECIST的反應(yīng)和治療時(shí)間著色。藍(lán)色的患者均接受研究治療>24周,其中2例患者的治療超過(guò)了基于RECIST的進(jìn)展性疾病(PD),在24周后未得到證實(shí),并繼續(xù)接受研究治療;圖d.自ChAd68啟動(dòng)以來(lái),ctDNA減少(=4)或沒(méi)有減少(=3)的MSS-CRC患者的生存概率。數(shù)據(jù)截止日期:2022年1月31日;

病人G8,51歲的MSS-CRC患者接受化療21個(gè)月,進(jìn)入研究隊(duì)列前的一線化療存在腫瘤進(jìn)展,后期接受腫瘤新生抗原疫苗時(shí)繼續(xù)伴隨標(biāo)準(zhǔn)的化療方案,通過(guò)影像學(xué)評(píng)估腫瘤縮小和ctDNA降低。16周內(nèi)多個(gè)肺病變部位縮小,48周內(nèi)多個(gè)肺和一個(gè)肝臟病變部位持續(xù)縮?。▓D12e)。PET掃描成像顯示穩(wěn)定性肝病變組織中高代謝細(xì)胞降低(提示該疫苗方案的抗腫瘤活性沒(méi)有被計(jì)算機(jī)斷層掃描成像所證明)

PET(正電子發(fā)射斷層攝影)是新發(fā)展起來(lái)的核醫(yī)學(xué)檢查方法。掃描前先給病人注射一種標(biāo)記某種正電子的放射性制劑,從它們所參與的代謝過(guò)程來(lái)測(cè)定腦組織的代謝改變。是目前惟一可在活體上顯示生物分子代謝、受體及神經(jīng)介質(zhì)活動(dòng)的新型影像技術(shù),現(xiàn)已廣泛用于多種疾病的診斷與鑒別診斷、病情判斷、療效評(píng)價(jià)、臟器功能研究和新藥開發(fā)等方面。

圖12. 在晚期癌癥患者群中,MSS-CRC患者出現(xiàn)臨床療效的早期信號(hào);圖e. 影像學(xué)圖片展示G8患者肺部和肝臟腫瘤在治療前后的病變:箭頭表示相關(guān)靶向病變

3. 展望

疫苗驅(qū)動(dòng)的T細(xì)胞應(yīng)答是(1)跨多重突變和HLA等位基因的多克隆,(2)具有多功能性,(3)能夠殺死呈現(xiàn)同源肽的靶細(xì)胞。值得注意的是,在接受低劑量samRNA的患者中觀察到T細(xì)胞反應(yīng)更一致的增加。

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